Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NinlQ6ZQ12 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NinlQ6ZQ12 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NinlQ6ZQ12 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NinlQ6ZQ12 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NinlQ6ZQ12 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NinlQ6ZQ12 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
NinlQ6ZQ12 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NinlQ6ZQ12 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
NinlQ6ZQ12 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NinlQ6ZQ12 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NinlQ6ZQ12 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NinlQ6ZQ12 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NinlQ6ZQ12 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
NinlQ6ZQ12 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NinlQ6ZQ12 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NinlQ6ZQ12 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NinlQ6ZQ12 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NinlQ6ZQ12 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NinlQ6ZQ12 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NinlQ6ZQ12 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NinlQ6ZQ12 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NinlQ6ZQ12 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
NinlQ6ZQ12 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NinlQ6ZQ12 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NinlQ6ZQ12 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NinlQ6ZQ12 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NinlQ6ZQ12 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NinlQ6ZQ12 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NinlQ6ZQ12 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NinlQ6ZQ12 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NinlQ6ZQ12 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NinlQ6ZQ12 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NinlQ6ZQ12 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
NinlQ6ZQ12 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NinlQ6ZQ12 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NinlQ6ZQ12 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NinlQ6ZQ12 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NinlQ6ZQ12 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
NinlQ6ZQ12 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NinlQ6ZQ12 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NinlQ6ZQ12 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NinlQ6ZQ12 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
NinlQ6ZQ12 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NinlQ6ZQ12 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NinlQ6ZQ12 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NinlQ6ZQ12 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NinlQ6ZQ12 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NinlQ6ZQ12 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NinlQ6ZQ12 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NinlQ6ZQ12 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NinlQ6ZQ12 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NinlQ6ZQ12 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NinlQ6ZQ12 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
NinlQ6ZQ12 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NinlQ6ZQ12 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
NinlQ6ZQ12 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NinlQ6ZQ12 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NinlQ6ZQ12 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NinlQ6ZQ12 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
NinlQ6ZQ12 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NinlQ6ZQ12 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NinlQ6ZQ12 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NinlQ6ZQ12 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NinlQ6ZQ12 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NinlQ6ZQ12 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NinlQ6ZQ12 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NinlQ6ZQ12 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NinlQ6ZQ12 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NinlQ6ZQ12 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NinlQ6ZQ12 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NinlQ6ZQ12 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NinlQ6ZQ12 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
NinlQ6ZQ12 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NinlQ6ZQ12 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NinlQ6ZQ12 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NinlQ6ZQ12 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NinlQ6ZQ12 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NinlQ6ZQ12 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NinlQ6ZQ12 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
NinlQ6ZQ12 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NinlQ6ZQ12 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NinlQ6ZQ12 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NinlQ6ZQ12 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NinlQ6ZQ12 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NinlQ6ZQ12 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NinlQ6ZQ12 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NinlQ6ZQ12 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NinlQ6ZQ12 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NinlQ6ZQ12 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NinlQ6ZQ12 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NinlQ6ZQ12 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NinlQ6ZQ12 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NinlQ6ZQ12 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NinlQ6ZQ12 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NinlQ6ZQ12 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NinlQ6ZQ12 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NinlQ6ZQ12 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NinlQ6ZQ12 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NinlQ6ZQ12 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
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