Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

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Length 800 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chsy1Q6ZQ11 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chsy1Q6ZQ11 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chsy1Q6ZQ11 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chsy1Q6ZQ11 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chsy1Q6ZQ11 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chsy1Q6ZQ11 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chsy1Q6ZQ11 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chsy1Q6ZQ11 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Chsy1Q6ZQ11 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chsy1Q6ZQ11 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chsy1Q6ZQ11 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Chsy1Q6ZQ11 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chsy1Q6ZQ11 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chsy1Q6ZQ11 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chsy1Q6ZQ11 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chsy1Q6ZQ11 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chsy1Q6ZQ11 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chsy1Q6ZQ11 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chsy1Q6ZQ11 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chsy1Q6ZQ11 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chsy1Q6ZQ11 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Chsy1Q6ZQ11 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chsy1Q6ZQ11 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chsy1Q6ZQ11 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chsy1Q6ZQ11 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chsy1Q6ZQ11 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chsy1Q6ZQ11 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chsy1Q6ZQ11 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chsy1Q6ZQ11 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chsy1Q6ZQ11 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chsy1Q6ZQ11 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chsy1Q6ZQ11 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chsy1Q6ZQ11 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chsy1Q6ZQ11 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Chsy1Q6ZQ11 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chsy1Q6ZQ11 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chsy1Q6ZQ11 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chsy1Q6ZQ11 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chsy1Q6ZQ11 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chsy1Q6ZQ11 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chsy1Q6ZQ11 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chsy1Q6ZQ11 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chsy1Q6ZQ11 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chsy1Q6ZQ11 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chsy1Q6ZQ11 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chsy1Q6ZQ11 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chsy1Q6ZQ11 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chsy1Q6ZQ11 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chsy1Q6ZQ11 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chsy1Q6ZQ11 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chsy1Q6ZQ11 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chsy1Q6ZQ11 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chsy1Q6ZQ11 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chsy1Q6ZQ11 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chsy1Q6ZQ11 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chsy1Q6ZQ11 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chsy1Q6ZQ11 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chsy1Q6ZQ11 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chsy1Q6ZQ11 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Chsy1Q6ZQ11 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chsy1Q6ZQ11 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Chsy1Q6ZQ11 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chsy1Q6ZQ11 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chsy1Q6ZQ11 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chsy1Q6ZQ11 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chsy1Q6ZQ11 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chsy1Q6ZQ11 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Chsy1Q6ZQ11 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Chsy1Q6ZQ11 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chsy1Q6ZQ11 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chsy1Q6ZQ11 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chsy1Q6ZQ11 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chsy1Q6ZQ11 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chsy1Q6ZQ11 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chsy1Q6ZQ11 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chsy1Q6ZQ11 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chsy1Q6ZQ11 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Chsy1Q6ZQ11 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chsy1Q6ZQ11 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chsy1Q6ZQ11 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chsy1Q6ZQ11 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chsy1Q6ZQ11 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chsy1Q6ZQ11 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chsy1Q6ZQ11 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chsy1Q6ZQ11 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chsy1Q6ZQ11 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chsy1Q6ZQ11 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chsy1Q6ZQ11 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chsy1Q6ZQ11 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chsy1Q6ZQ11 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chsy1Q6ZQ11 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chsy1Q6ZQ11 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chsy1Q6ZQ11 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chsy1Q6ZQ11 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chsy1Q6ZQ11 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chsy1Q6ZQ11 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chsy1Q6ZQ11 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chsy1Q6ZQ11 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chsy1Q6ZQ11 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms