Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPS2

Carns1, Carnosine synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carns1Q6ZPS2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Carns1Q6ZPS2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Carns1Q6ZPS2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Carns1Q6ZPS2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Carns1Q6ZPS2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Carns1Q6ZPS2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Carns1Q6ZPS2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Carns1Q6ZPS2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Carns1Q6ZPS2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Carns1Q6ZPS2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Carns1Q6ZPS2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Carns1Q6ZPS2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Carns1Q6ZPS2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Carns1Q6ZPS2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Carns1Q6ZPS2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Carns1Q6ZPS2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Carns1Q6ZPS2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Carns1Q6ZPS2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Carns1Q6ZPS2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Carns1Q6ZPS2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Carns1Q6ZPS2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Carns1Q6ZPS2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Carns1Q6ZPS2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Carns1Q6ZPS2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Carns1Q6ZPS2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Carns1Q6ZPS2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Carns1Q6ZPS2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Carns1Q6ZPS2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Carns1Q6ZPS2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Carns1Q6ZPS2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Carns1Q6ZPS2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Carns1Q6ZPS2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Carns1Q6ZPS2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Carns1Q6ZPS2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Carns1Q6ZPS2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Carns1Q6ZPS2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Carns1Q6ZPS2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Carns1Q6ZPS2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Carns1Q6ZPS2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Carns1Q6ZPS2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Carns1Q6ZPS2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Carns1Q6ZPS2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Carns1Q6ZPS2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Carns1Q6ZPS2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Carns1Q6ZPS2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Carns1Q6ZPS2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Carns1Q6ZPS2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Carns1Q6ZPS2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Carns1Q6ZPS2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Carns1Q6ZPS2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Carns1Q6ZPS2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Carns1Q6ZPS2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Carns1Q6ZPS2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Carns1Q6ZPS2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Carns1Q6ZPS2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Carns1Q6ZPS2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Carns1Q6ZPS2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Carns1Q6ZPS2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Carns1Q6ZPS2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Carns1Q6ZPS2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Carns1Q6ZPS2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Carns1Q6ZPS2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Carns1Q6ZPS2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Carns1Q6ZPS2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Carns1Q6ZPS2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Carns1Q6ZPS2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Carns1Q6ZPS2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Carns1Q6ZPS2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Carns1Q6ZPS2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Carns1Q6ZPS2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Carns1Q6ZPS2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Carns1Q6ZPS2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Carns1Q6ZPS2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Carns1Q6ZPS2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Carns1Q6ZPS2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Carns1Q6ZPS2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Carns1Q6ZPS2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Carns1Q6ZPS2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Carns1Q6ZPS2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Carns1Q6ZPS2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Carns1Q6ZPS2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Carns1Q6ZPS2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Carns1Q6ZPS2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Carns1Q6ZPS2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Carns1Q6ZPS2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Carns1Q6ZPS2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Carns1Q6ZPS2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Carns1Q6ZPS2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Carns1Q6ZPS2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Carns1Q6ZPS2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Carns1Q6ZPS2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Carns1Q6ZPS2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Carns1Q6ZPS2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Carns1Q6ZPS2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Carns1Q6ZPS2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Carns1Q6ZPS2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Carns1Q6ZPS2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Carns1Q6ZPS2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Carns1Q6ZPS2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Carns1Q6ZPS2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms