Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Ift172Q6VH22 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ift172Q6VH22 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ift172Q6VH22 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ift172Q6VH22 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ift172Q6VH22 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ift172Q6VH22 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ift172Q6VH22 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ift172Q6VH22 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ift172Q6VH22 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ift172Q6VH22 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ift172Q6VH22 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ift172Q6VH22 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Ift172Q6VH22 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ift172Q6VH22 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ift172Q6VH22 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ift172Q6VH22 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ift172Q6VH22 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ift172Q6VH22 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ift172Q6VH22 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Ift172Q6VH22 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ift172Q6VH22 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ift172Q6VH22 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Ift172Q6VH22 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ift172Q6VH22 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ift172Q6VH22 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ift172Q6VH22 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ift172Q6VH22 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ift172Q6VH22 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ift172Q6VH22 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ift172Q6VH22 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ift172Q6VH22 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ift172Q6VH22 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ift172Q6VH22 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ift172Q6VH22 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ift172Q6VH22 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ift172Q6VH22 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ift172Q6VH22 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ift172Q6VH22 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ift172Q6VH22 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ift172Q6VH22 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ift172Q6VH22 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ift172Q6VH22 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ift172Q6VH22 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ift172Q6VH22 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ift172Q6VH22 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ift172Q6VH22 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Ift172Q6VH22 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Ift172Q6VH22 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Ift172Q6VH22 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Ift172Q6VH22 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Ift172Q6VH22 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ift172Q6VH22 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ift172Q6VH22 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ift172Q6VH22 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ift172Q6VH22 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ift172Q6VH22 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ift172Q6VH22 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ift172Q6VH22 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ift172Q6VH22 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ift172Q6VH22 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ift172Q6VH22 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ift172Q6VH22 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ift172Q6VH22 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ift172Q6VH22 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Ift172Q6VH22 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ift172Q6VH22 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ift172Q6VH22 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ift172Q6VH22 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.41
Ift172Q6VH22 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ift172Q6VH22 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Ift172Q6VH22 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ift172Q6VH22 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ift172Q6VH22 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Ift172Q6VH22 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ift172Q6VH22 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ift172Q6VH22 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Ift172Q6VH22 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Ift172Q6VH22 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ift172Q6VH22 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ift172Q6VH22 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ift172Q6VH22 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ift172Q6VH22 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ift172Q6VH22 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ift172Q6VH22 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ift172Q6VH22 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Ift172Q6VH22 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ift172Q6VH22 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ift172Q6VH22 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ift172Q6VH22 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ift172Q6VH22 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ift172Q6VH22 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ift172Q6VH22 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ift172Q6VH22 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ift172Q6VH22 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Ift172Q6VH22 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ift172Q6VH22 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ift172Q6VH22 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ift172Q6VH22 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ift172Q6VH22 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms