Protein–RNA interactions for Protein: Q6T3U4

Npc1l1, Niemann-Pick C1-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npc1l1Q6T3U4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Npc1l1Q6T3U4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Npc1l1Q6T3U4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Npc1l1Q6T3U4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Npc1l1Q6T3U4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Npc1l1Q6T3U4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Npc1l1Q6T3U4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Npc1l1Q6T3U4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Npc1l1Q6T3U4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Npc1l1Q6T3U4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Npc1l1Q6T3U4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Npc1l1Q6T3U4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Npc1l1Q6T3U4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Npc1l1Q6T3U4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Npc1l1Q6T3U4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Npc1l1Q6T3U4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Npc1l1Q6T3U4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Npc1l1Q6T3U4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Npc1l1Q6T3U4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Npc1l1Q6T3U4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Npc1l1Q6T3U4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Npc1l1Q6T3U4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Npc1l1Q6T3U4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Npc1l1Q6T3U4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Npc1l1Q6T3U4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Npc1l1Q6T3U4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Npc1l1Q6T3U4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Npc1l1Q6T3U4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Npc1l1Q6T3U4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Npc1l1Q6T3U4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Npc1l1Q6T3U4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Npc1l1Q6T3U4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Npc1l1Q6T3U4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Npc1l1Q6T3U4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Npc1l1Q6T3U4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Npc1l1Q6T3U4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Npc1l1Q6T3U4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Npc1l1Q6T3U4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Npc1l1Q6T3U4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Npc1l1Q6T3U4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Npc1l1Q6T3U4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Npc1l1Q6T3U4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Npc1l1Q6T3U4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Npc1l1Q6T3U4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Npc1l1Q6T3U4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Npc1l1Q6T3U4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Npc1l1Q6T3U4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Npc1l1Q6T3U4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Npc1l1Q6T3U4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Npc1l1Q6T3U4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Npc1l1Q6T3U4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Npc1l1Q6T3U4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Npc1l1Q6T3U4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Npc1l1Q6T3U4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Npc1l1Q6T3U4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Npc1l1Q6T3U4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Npc1l1Q6T3U4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Npc1l1Q6T3U4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Npc1l1Q6T3U4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Npc1l1Q6T3U4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Npc1l1Q6T3U4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Npc1l1Q6T3U4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Npc1l1Q6T3U4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Npc1l1Q6T3U4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Npc1l1Q6T3U4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Npc1l1Q6T3U4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Npc1l1Q6T3U4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Npc1l1Q6T3U4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Npc1l1Q6T3U4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Npc1l1Q6T3U4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Npc1l1Q6T3U4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Npc1l1Q6T3U4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Npc1l1Q6T3U4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Npc1l1Q6T3U4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Npc1l1Q6T3U4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Npc1l1Q6T3U4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Npc1l1Q6T3U4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Npc1l1Q6T3U4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Npc1l1Q6T3U4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Npc1l1Q6T3U4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Npc1l1Q6T3U4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Npc1l1Q6T3U4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Npc1l1Q6T3U4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Npc1l1Q6T3U4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Npc1l1Q6T3U4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Npc1l1Q6T3U4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Npc1l1Q6T3U4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Npc1l1Q6T3U4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Npc1l1Q6T3U4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Npc1l1Q6T3U4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Npc1l1Q6T3U4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Npc1l1Q6T3U4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Npc1l1Q6T3U4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Npc1l1Q6T3U4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Npc1l1Q6T3U4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Npc1l1Q6T3U4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Npc1l1Q6T3U4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Npc1l1Q6T3U4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Npc1l1Q6T3U4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Npc1l1Q6T3U4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms