Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIC6

Atp1a3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a3Q6PIC6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp1a3Q6PIC6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp1a3Q6PIC6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp1a3Q6PIC6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atp1a3Q6PIC6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp1a3Q6PIC6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp1a3Q6PIC6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp1a3Q6PIC6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp1a3Q6PIC6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp1a3Q6PIC6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp1a3Q6PIC6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp1a3Q6PIC6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp1a3Q6PIC6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp1a3Q6PIC6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp1a3Q6PIC6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp1a3Q6PIC6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp1a3Q6PIC6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp1a3Q6PIC6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp1a3Q6PIC6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp1a3Q6PIC6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp1a3Q6PIC6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp1a3Q6PIC6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp1a3Q6PIC6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp1a3Q6PIC6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp1a3Q6PIC6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp1a3Q6PIC6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp1a3Q6PIC6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp1a3Q6PIC6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp1a3Q6PIC6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp1a3Q6PIC6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp1a3Q6PIC6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp1a3Q6PIC6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp1a3Q6PIC6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp1a3Q6PIC6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp1a3Q6PIC6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp1a3Q6PIC6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp1a3Q6PIC6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp1a3Q6PIC6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp1a3Q6PIC6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp1a3Q6PIC6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp1a3Q6PIC6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp1a3Q6PIC6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp1a3Q6PIC6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp1a3Q6PIC6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp1a3Q6PIC6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp1a3Q6PIC6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp1a3Q6PIC6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp1a3Q6PIC6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp1a3Q6PIC6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp1a3Q6PIC6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp1a3Q6PIC6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp1a3Q6PIC6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp1a3Q6PIC6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp1a3Q6PIC6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp1a3Q6PIC6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp1a3Q6PIC6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp1a3Q6PIC6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp1a3Q6PIC6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp1a3Q6PIC6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atp1a3Q6PIC6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp1a3Q6PIC6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp1a3Q6PIC6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp1a3Q6PIC6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp1a3Q6PIC6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp1a3Q6PIC6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp1a3Q6PIC6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp1a3Q6PIC6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp1a3Q6PIC6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp1a3Q6PIC6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp1a3Q6PIC6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp1a3Q6PIC6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp1a3Q6PIC6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp1a3Q6PIC6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp1a3Q6PIC6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp1a3Q6PIC6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp1a3Q6PIC6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp1a3Q6PIC6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp1a3Q6PIC6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp1a3Q6PIC6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp1a3Q6PIC6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp1a3Q6PIC6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp1a3Q6PIC6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp1a3Q6PIC6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp1a3Q6PIC6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp1a3Q6PIC6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp1a3Q6PIC6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp1a3Q6PIC6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp1a3Q6PIC6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp1a3Q6PIC6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp1a3Q6PIC6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp1a3Q6PIC6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp1a3Q6PIC6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp1a3Q6PIC6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp1a3Q6PIC6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atp1a3Q6PIC6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atp1a3Q6PIC6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atp1a3Q6PIC6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atp1a3Q6PIC6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp1a3Q6PIC6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp1a3Q6PIC6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms