Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHU5

Sort1, Sortilin, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sort1Q6PHU5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sort1Q6PHU5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sort1Q6PHU5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sort1Q6PHU5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sort1Q6PHU5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sort1Q6PHU5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sort1Q6PHU5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sort1Q6PHU5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sort1Q6PHU5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sort1Q6PHU5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sort1Q6PHU5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sort1Q6PHU5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sort1Q6PHU5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sort1Q6PHU5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sort1Q6PHU5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sort1Q6PHU5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sort1Q6PHU5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sort1Q6PHU5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sort1Q6PHU5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sort1Q6PHU5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sort1Q6PHU5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sort1Q6PHU5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sort1Q6PHU5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sort1Q6PHU5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sort1Q6PHU5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sort1Q6PHU5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sort1Q6PHU5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sort1Q6PHU5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sort1Q6PHU5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sort1Q6PHU5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sort1Q6PHU5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sort1Q6PHU5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sort1Q6PHU5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sort1Q6PHU5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sort1Q6PHU5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sort1Q6PHU5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sort1Q6PHU5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sort1Q6PHU5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sort1Q6PHU5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sort1Q6PHU5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sort1Q6PHU5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sort1Q6PHU5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sort1Q6PHU5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sort1Q6PHU5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sort1Q6PHU5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sort1Q6PHU5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sort1Q6PHU5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Sort1Q6PHU5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Sort1Q6PHU5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sort1Q6PHU5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sort1Q6PHU5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Sort1Q6PHU5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sort1Q6PHU5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sort1Q6PHU5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sort1Q6PHU5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sort1Q6PHU5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sort1Q6PHU5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sort1Q6PHU5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sort1Q6PHU5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sort1Q6PHU5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sort1Q6PHU5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sort1Q6PHU5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sort1Q6PHU5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sort1Q6PHU5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sort1Q6PHU5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sort1Q6PHU5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sort1Q6PHU5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sort1Q6PHU5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sort1Q6PHU5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sort1Q6PHU5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sort1Q6PHU5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sort1Q6PHU5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sort1Q6PHU5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sort1Q6PHU5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Sort1Q6PHU5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Sort1Q6PHU5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Sort1Q6PHU5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Sort1Q6PHU5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Sort1Q6PHU5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sort1Q6PHU5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sort1Q6PHU5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sort1Q6PHU5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sort1Q6PHU5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sort1Q6PHU5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sort1Q6PHU5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sort1Q6PHU5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sort1Q6PHU5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sort1Q6PHU5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sort1Q6PHU5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sort1Q6PHU5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sort1Q6PHU5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sort1Q6PHU5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sort1Q6PHU5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sort1Q6PHU5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sort1Q6PHU5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sort1Q6PHU5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sort1Q6PHU5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Sort1Q6PHU5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sort1Q6PHU5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sort1Q6PHU5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms