Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scaf4Q6PFF0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scaf4Q6PFF0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scaf4Q6PFF0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scaf4Q6PFF0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scaf4Q6PFF0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Scaf4Q6PFF0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Scaf4Q6PFF0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Scaf4Q6PFF0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Scaf4Q6PFF0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scaf4Q6PFF0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scaf4Q6PFF0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scaf4Q6PFF0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Scaf4Q6PFF0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scaf4Q6PFF0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scaf4Q6PFF0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scaf4Q6PFF0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Scaf4Q6PFF0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scaf4Q6PFF0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Scaf4Q6PFF0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scaf4Q6PFF0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Scaf4Q6PFF0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Scaf4Q6PFF0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Scaf4Q6PFF0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scaf4Q6PFF0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scaf4Q6PFF0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scaf4Q6PFF0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scaf4Q6PFF0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scaf4Q6PFF0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scaf4Q6PFF0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scaf4Q6PFF0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Scaf4Q6PFF0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scaf4Q6PFF0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scaf4Q6PFF0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scaf4Q6PFF0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scaf4Q6PFF0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scaf4Q6PFF0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scaf4Q6PFF0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Scaf4Q6PFF0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scaf4Q6PFF0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Scaf4Q6PFF0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scaf4Q6PFF0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scaf4Q6PFF0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scaf4Q6PFF0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Scaf4Q6PFF0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Scaf4Q6PFF0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scaf4Q6PFF0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scaf4Q6PFF0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scaf4Q6PFF0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scaf4Q6PFF0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Scaf4Q6PFF0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scaf4Q6PFF0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scaf4Q6PFF0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scaf4Q6PFF0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scaf4Q6PFF0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scaf4Q6PFF0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scaf4Q6PFF0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scaf4Q6PFF0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scaf4Q6PFF0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scaf4Q6PFF0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scaf4Q6PFF0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scaf4Q6PFF0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scaf4Q6PFF0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scaf4Q6PFF0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scaf4Q6PFF0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scaf4Q6PFF0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scaf4Q6PFF0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scaf4Q6PFF0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scaf4Q6PFF0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scaf4Q6PFF0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scaf4Q6PFF0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scaf4Q6PFF0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scaf4Q6PFF0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scaf4Q6PFF0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scaf4Q6PFF0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scaf4Q6PFF0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scaf4Q6PFF0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scaf4Q6PFF0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scaf4Q6PFF0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scaf4Q6PFF0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scaf4Q6PFF0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scaf4Q6PFF0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scaf4Q6PFF0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scaf4Q6PFF0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scaf4Q6PFF0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scaf4Q6PFF0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scaf4Q6PFF0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scaf4Q6PFF0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scaf4Q6PFF0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scaf4Q6PFF0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scaf4Q6PFF0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scaf4Q6PFF0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scaf4Q6PFF0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scaf4Q6PFF0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scaf4Q6PFF0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scaf4Q6PFF0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scaf4Q6PFF0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scaf4Q6PFF0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scaf4Q6PFF0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scaf4Q6PFF0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 186 ms