Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rad54bQ6PFE3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rad54bQ6PFE3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rad54bQ6PFE3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rad54bQ6PFE3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rad54bQ6PFE3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rad54bQ6PFE3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rad54bQ6PFE3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rad54bQ6PFE3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rad54bQ6PFE3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Rad54bQ6PFE3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad54bQ6PFE3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad54bQ6PFE3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad54bQ6PFE3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad54bQ6PFE3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad54bQ6PFE3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad54bQ6PFE3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad54bQ6PFE3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad54bQ6PFE3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad54bQ6PFE3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad54bQ6PFE3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rad54bQ6PFE3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rad54bQ6PFE3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rad54bQ6PFE3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rad54bQ6PFE3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rad54bQ6PFE3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rad54bQ6PFE3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad54bQ6PFE3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad54bQ6PFE3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad54bQ6PFE3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad54bQ6PFE3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad54bQ6PFE3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad54bQ6PFE3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad54bQ6PFE3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad54bQ6PFE3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad54bQ6PFE3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rad54bQ6PFE3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rad54bQ6PFE3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad54bQ6PFE3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad54bQ6PFE3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad54bQ6PFE3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad54bQ6PFE3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad54bQ6PFE3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad54bQ6PFE3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad54bQ6PFE3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad54bQ6PFE3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad54bQ6PFE3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad54bQ6PFE3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad54bQ6PFE3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad54bQ6PFE3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad54bQ6PFE3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad54bQ6PFE3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad54bQ6PFE3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad54bQ6PFE3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad54bQ6PFE3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad54bQ6PFE3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad54bQ6PFE3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad54bQ6PFE3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad54bQ6PFE3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad54bQ6PFE3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rad54bQ6PFE3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rad54bQ6PFE3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Rad54bQ6PFE3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rad54bQ6PFE3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rad54bQ6PFE3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rad54bQ6PFE3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rad54bQ6PFE3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rad54bQ6PFE3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rad54bQ6PFE3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rad54bQ6PFE3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rad54bQ6PFE3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rad54bQ6PFE3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rad54bQ6PFE3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rad54bQ6PFE3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rad54bQ6PFE3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rad54bQ6PFE3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Rad54bQ6PFE3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rad54bQ6PFE3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rad54bQ6PFE3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rad54bQ6PFE3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rad54bQ6PFE3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rad54bQ6PFE3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rad54bQ6PFE3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rad54bQ6PFE3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Rad54bQ6PFE3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rad54bQ6PFE3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rad54bQ6PFE3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rad54bQ6PFE3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rad54bQ6PFE3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rad54bQ6PFE3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rad54bQ6PFE3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rad54bQ6PFE3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rad54bQ6PFE3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rad54bQ6PFE3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rad54bQ6PFE3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rad54bQ6PFE3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rad54bQ6PFE3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Rad54bQ6PFE3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rad54bQ6PFE3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rad54bQ6PFE3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms