Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PdgfrlQ6PE55 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PdgfrlQ6PE55 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PdgfrlQ6PE55 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PdgfrlQ6PE55 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PdgfrlQ6PE55 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PdgfrlQ6PE55 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PdgfrlQ6PE55 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PdgfrlQ6PE55 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PdgfrlQ6PE55 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PdgfrlQ6PE55 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PdgfrlQ6PE55 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PdgfrlQ6PE55 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PdgfrlQ6PE55 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PdgfrlQ6PE55 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PdgfrlQ6PE55 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PdgfrlQ6PE55 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PdgfrlQ6PE55 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PdgfrlQ6PE55 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PdgfrlQ6PE55 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PdgfrlQ6PE55 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PdgfrlQ6PE55 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PdgfrlQ6PE55 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PdgfrlQ6PE55 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PdgfrlQ6PE55 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PdgfrlQ6PE55 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PdgfrlQ6PE55 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PdgfrlQ6PE55 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PdgfrlQ6PE55 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PdgfrlQ6PE55 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PdgfrlQ6PE55 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PdgfrlQ6PE55 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PdgfrlQ6PE55 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PdgfrlQ6PE55 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PdgfrlQ6PE55 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PdgfrlQ6PE55 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PdgfrlQ6PE55 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PdgfrlQ6PE55 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PdgfrlQ6PE55 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PdgfrlQ6PE55 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PdgfrlQ6PE55 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PdgfrlQ6PE55 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PdgfrlQ6PE55 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PdgfrlQ6PE55 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PdgfrlQ6PE55 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PdgfrlQ6PE55 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PdgfrlQ6PE55 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PdgfrlQ6PE55 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PdgfrlQ6PE55 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PdgfrlQ6PE55 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PdgfrlQ6PE55 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PdgfrlQ6PE55 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PdgfrlQ6PE55 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PdgfrlQ6PE55 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PdgfrlQ6PE55 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PdgfrlQ6PE55 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PdgfrlQ6PE55 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PdgfrlQ6PE55 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PdgfrlQ6PE55 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PdgfrlQ6PE55 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PdgfrlQ6PE55 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PdgfrlQ6PE55 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PdgfrlQ6PE55 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PdgfrlQ6PE55 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PdgfrlQ6PE55 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PdgfrlQ6PE55 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PdgfrlQ6PE55 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PdgfrlQ6PE55 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PdgfrlQ6PE55 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PdgfrlQ6PE55 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PdgfrlQ6PE55 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PdgfrlQ6PE55 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PdgfrlQ6PE55 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PdgfrlQ6PE55 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PdgfrlQ6PE55 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PdgfrlQ6PE55 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PdgfrlQ6PE55 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PdgfrlQ6PE55 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PdgfrlQ6PE55 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PdgfrlQ6PE55 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PdgfrlQ6PE55 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PdgfrlQ6PE55 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PdgfrlQ6PE55 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PdgfrlQ6PE55 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PdgfrlQ6PE55 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PdgfrlQ6PE55 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PdgfrlQ6PE55 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PdgfrlQ6PE55 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PdgfrlQ6PE55 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PdgfrlQ6PE55 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PdgfrlQ6PE55 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PdgfrlQ6PE55 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PdgfrlQ6PE55 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PdgfrlQ6PE55 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PdgfrlQ6PE55 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PdgfrlQ6PE55 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PdgfrlQ6PE55 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PdgfrlQ6PE55 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PdgfrlQ6PE55 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PdgfrlQ6PE55 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.3 ms