Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX7

Rgma, Repulsive guidance molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmaQ6PCX7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RgmaQ6PCX7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RgmaQ6PCX7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RgmaQ6PCX7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RgmaQ6PCX7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RgmaQ6PCX7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RgmaQ6PCX7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RgmaQ6PCX7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RgmaQ6PCX7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RgmaQ6PCX7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RgmaQ6PCX7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RgmaQ6PCX7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RgmaQ6PCX7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RgmaQ6PCX7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RgmaQ6PCX7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RgmaQ6PCX7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RgmaQ6PCX7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RgmaQ6PCX7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RgmaQ6PCX7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RgmaQ6PCX7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RgmaQ6PCX7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RgmaQ6PCX7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RgmaQ6PCX7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RgmaQ6PCX7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RgmaQ6PCX7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RgmaQ6PCX7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RgmaQ6PCX7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RgmaQ6PCX7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RgmaQ6PCX7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RgmaQ6PCX7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RgmaQ6PCX7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RgmaQ6PCX7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RgmaQ6PCX7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RgmaQ6PCX7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RgmaQ6PCX7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RgmaQ6PCX7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RgmaQ6PCX7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RgmaQ6PCX7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RgmaQ6PCX7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RgmaQ6PCX7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RgmaQ6PCX7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
RgmaQ6PCX7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RgmaQ6PCX7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RgmaQ6PCX7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RgmaQ6PCX7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RgmaQ6PCX7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RgmaQ6PCX7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RgmaQ6PCX7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RgmaQ6PCX7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RgmaQ6PCX7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RgmaQ6PCX7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RgmaQ6PCX7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RgmaQ6PCX7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RgmaQ6PCX7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RgmaQ6PCX7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RgmaQ6PCX7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RgmaQ6PCX7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RgmaQ6PCX7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RgmaQ6PCX7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RgmaQ6PCX7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RgmaQ6PCX7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RgmaQ6PCX7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RgmaQ6PCX7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RgmaQ6PCX7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RgmaQ6PCX7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RgmaQ6PCX7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RgmaQ6PCX7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RgmaQ6PCX7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RgmaQ6PCX7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RgmaQ6PCX7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RgmaQ6PCX7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RgmaQ6PCX7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RgmaQ6PCX7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RgmaQ6PCX7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RgmaQ6PCX7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RgmaQ6PCX7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RgmaQ6PCX7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RgmaQ6PCX7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RgmaQ6PCX7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RgmaQ6PCX7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RgmaQ6PCX7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RgmaQ6PCX7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RgmaQ6PCX7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RgmaQ6PCX7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RgmaQ6PCX7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RgmaQ6PCX7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RgmaQ6PCX7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RgmaQ6PCX7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RgmaQ6PCX7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RgmaQ6PCX7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RgmaQ6PCX7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RgmaQ6PCX7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RgmaQ6PCX7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RgmaQ6PCX7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RgmaQ6PCX7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RgmaQ6PCX7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RgmaQ6PCX7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RgmaQ6PCX7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RgmaQ6PCX7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RgmaQ6PCX7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms