Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Herc4Q6PAV2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Herc4Q6PAV2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Herc4Q6PAV2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Herc4Q6PAV2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Herc4Q6PAV2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Herc4Q6PAV2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Herc4Q6PAV2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Herc4Q6PAV2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Herc4Q6PAV2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Herc4Q6PAV2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Herc4Q6PAV2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Herc4Q6PAV2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Herc4Q6PAV2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Herc4Q6PAV2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Herc4Q6PAV2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Herc4Q6PAV2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Herc4Q6PAV2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Herc4Q6PAV2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Herc4Q6PAV2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Herc4Q6PAV2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Herc4Q6PAV2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Herc4Q6PAV2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Herc4Q6PAV2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Herc4Q6PAV2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Herc4Q6PAV2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Herc4Q6PAV2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Herc4Q6PAV2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Herc4Q6PAV2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Herc4Q6PAV2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Herc4Q6PAV2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Herc4Q6PAV2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Herc4Q6PAV2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Herc4Q6PAV2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Herc4Q6PAV2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Herc4Q6PAV2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Herc4Q6PAV2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Herc4Q6PAV2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Herc4Q6PAV2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Herc4Q6PAV2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Herc4Q6PAV2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Herc4Q6PAV2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Herc4Q6PAV2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Herc4Q6PAV2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Herc4Q6PAV2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Herc4Q6PAV2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Herc4Q6PAV2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Herc4Q6PAV2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Herc4Q6PAV2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Herc4Q6PAV2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Herc4Q6PAV2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Herc4Q6PAV2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Herc4Q6PAV2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Herc4Q6PAV2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Herc4Q6PAV2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Herc4Q6PAV2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Herc4Q6PAV2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Herc4Q6PAV2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Herc4Q6PAV2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Herc4Q6PAV2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Herc4Q6PAV2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Herc4Q6PAV2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Herc4Q6PAV2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Herc4Q6PAV2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Herc4Q6PAV2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Herc4Q6PAV2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Herc4Q6PAV2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Herc4Q6PAV2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Herc4Q6PAV2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Herc4Q6PAV2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Herc4Q6PAV2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Herc4Q6PAV2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Herc4Q6PAV2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Herc4Q6PAV2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Herc4Q6PAV2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Herc4Q6PAV2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Herc4Q6PAV2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Herc4Q6PAV2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Herc4Q6PAV2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Herc4Q6PAV2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Herc4Q6PAV2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Herc4Q6PAV2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Herc4Q6PAV2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Herc4Q6PAV2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Herc4Q6PAV2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Herc4Q6PAV2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Herc4Q6PAV2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Herc4Q6PAV2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Herc4Q6PAV2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Herc4Q6PAV2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Herc4Q6PAV2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Herc4Q6PAV2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Herc4Q6PAV2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Herc4Q6PAV2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Herc4Q6PAV2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Herc4Q6PAV2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Herc4Q6PAV2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Herc4Q6PAV2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Herc4Q6PAV2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Herc4Q6PAV2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.4 ms