Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAM0

Prkab2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab2Q6PAM0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prkab2Q6PAM0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prkab2Q6PAM0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prkab2Q6PAM0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prkab2Q6PAM0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prkab2Q6PAM0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prkab2Q6PAM0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prkab2Q6PAM0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Prkab2Q6PAM0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prkab2Q6PAM0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Prkab2Q6PAM0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prkab2Q6PAM0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prkab2Q6PAM0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prkab2Q6PAM0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Prkab2Q6PAM0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prkab2Q6PAM0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Prkab2Q6PAM0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Prkab2Q6PAM0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Prkab2Q6PAM0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Prkab2Q6PAM0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Prkab2Q6PAM0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Prkab2Q6PAM0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prkab2Q6PAM0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prkab2Q6PAM0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prkab2Q6PAM0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prkab2Q6PAM0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prkab2Q6PAM0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Prkab2Q6PAM0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Prkab2Q6PAM0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Prkab2Q6PAM0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Prkab2Q6PAM0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Prkab2Q6PAM0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Prkab2Q6PAM0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Prkab2Q6PAM0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prkab2Q6PAM0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prkab2Q6PAM0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prkab2Q6PAM0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prkab2Q6PAM0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prkab2Q6PAM0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prkab2Q6PAM0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Prkab2Q6PAM0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prkab2Q6PAM0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prkab2Q6PAM0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prkab2Q6PAM0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prkab2Q6PAM0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prkab2Q6PAM0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Prkab2Q6PAM0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prkab2Q6PAM0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prkab2Q6PAM0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prkab2Q6PAM0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prkab2Q6PAM0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prkab2Q6PAM0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Prkab2Q6PAM0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Prkab2Q6PAM0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Prkab2Q6PAM0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Prkab2Q6PAM0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Prkab2Q6PAM0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Prkab2Q6PAM0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Prkab2Q6PAM0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Prkab2Q6PAM0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prkab2Q6PAM0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prkab2Q6PAM0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prkab2Q6PAM0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prkab2Q6PAM0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prkab2Q6PAM0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prkab2Q6PAM0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prkab2Q6PAM0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prkab2Q6PAM0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Prkab2Q6PAM0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Prkab2Q6PAM0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Prkab2Q6PAM0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Prkab2Q6PAM0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Prkab2Q6PAM0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Prkab2Q6PAM0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Prkab2Q6PAM0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Prkab2Q6PAM0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Prkab2Q6PAM0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Prkab2Q6PAM0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Prkab2Q6PAM0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Prkab2Q6PAM0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Prkab2Q6PAM0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Prkab2Q6PAM0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prkab2Q6PAM0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prkab2Q6PAM0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prkab2Q6PAM0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prkab2Q6PAM0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Prkab2Q6PAM0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prkab2Q6PAM0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prkab2Q6PAM0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prkab2Q6PAM0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prkab2Q6PAM0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prkab2Q6PAM0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prkab2Q6PAM0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prkab2Q6PAM0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prkab2Q6PAM0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prkab2Q6PAM0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prkab2Q6PAM0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prkab2Q6PAM0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prkab2Q6PAM0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Prkab2Q6PAM0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms