Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9N8

Trak2, Trafficking protein, kinesin-binding 2, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak2Q6P9N8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trak2Q6P9N8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trak2Q6P9N8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trak2Q6P9N8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trak2Q6P9N8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Trak2Q6P9N8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trak2Q6P9N8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trak2Q6P9N8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trak2Q6P9N8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trak2Q6P9N8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trak2Q6P9N8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trak2Q6P9N8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trak2Q6P9N8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trak2Q6P9N8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trak2Q6P9N8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trak2Q6P9N8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trak2Q6P9N8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trak2Q6P9N8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trak2Q6P9N8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trak2Q6P9N8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trak2Q6P9N8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trak2Q6P9N8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trak2Q6P9N8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trak2Q6P9N8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trak2Q6P9N8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trak2Q6P9N8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trak2Q6P9N8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Trak2Q6P9N8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trak2Q6P9N8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trak2Q6P9N8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trak2Q6P9N8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trak2Q6P9N8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trak2Q6P9N8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Trak2Q6P9N8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trak2Q6P9N8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trak2Q6P9N8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trak2Q6P9N8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trak2Q6P9N8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trak2Q6P9N8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trak2Q6P9N8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trak2Q6P9N8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trak2Q6P9N8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trak2Q6P9N8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trak2Q6P9N8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trak2Q6P9N8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trak2Q6P9N8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trak2Q6P9N8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trak2Q6P9N8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trak2Q6P9N8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trak2Q6P9N8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trak2Q6P9N8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trak2Q6P9N8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trak2Q6P9N8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trak2Q6P9N8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trak2Q6P9N8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Trak2Q6P9N8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trak2Q6P9N8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trak2Q6P9N8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trak2Q6P9N8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trak2Q6P9N8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trak2Q6P9N8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trak2Q6P9N8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trak2Q6P9N8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trak2Q6P9N8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trak2Q6P9N8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trak2Q6P9N8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trak2Q6P9N8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Trak2Q6P9N8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trak2Q6P9N8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trak2Q6P9N8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trak2Q6P9N8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trak2Q6P9N8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trak2Q6P9N8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trak2Q6P9N8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trak2Q6P9N8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Trak2Q6P9N8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trak2Q6P9N8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trak2Q6P9N8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trak2Q6P9N8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trak2Q6P9N8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trak2Q6P9N8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trak2Q6P9N8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trak2Q6P9N8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trak2Q6P9N8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trak2Q6P9N8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trak2Q6P9N8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trak2Q6P9N8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trak2Q6P9N8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trak2Q6P9N8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trak2Q6P9N8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trak2Q6P9N8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trak2Q6P9N8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trak2Q6P9N8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trak2Q6P9N8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trak2Q6P9N8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Trak2Q6P9N8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trak2Q6P9N8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trak2Q6P9N8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trak2Q6P9N8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trak2Q6P9N8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms