Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rrp12Q6P5B0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rrp12Q6P5B0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rrp12Q6P5B0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Rrp12Q6P5B0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rrp12Q6P5B0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rrp12Q6P5B0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rrp12Q6P5B0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rrp12Q6P5B0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rrp12Q6P5B0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rrp12Q6P5B0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rrp12Q6P5B0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rrp12Q6P5B0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rrp12Q6P5B0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rrp12Q6P5B0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rrp12Q6P5B0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rrp12Q6P5B0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rrp12Q6P5B0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rrp12Q6P5B0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rrp12Q6P5B0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rrp12Q6P5B0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Rrp12Q6P5B0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rrp12Q6P5B0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rrp12Q6P5B0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Rrp12Q6P5B0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rrp12Q6P5B0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rrp12Q6P5B0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rrp12Q6P5B0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rrp12Q6P5B0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rrp12Q6P5B0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rrp12Q6P5B0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rrp12Q6P5B0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rrp12Q6P5B0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Rrp12Q6P5B0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rrp12Q6P5B0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rrp12Q6P5B0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Rrp12Q6P5B0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rrp12Q6P5B0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rrp12Q6P5B0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Rrp12Q6P5B0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Rrp12Q6P5B0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Rrp12Q6P5B0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rrp12Q6P5B0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rrp12Q6P5B0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rrp12Q6P5B0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rrp12Q6P5B0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rrp12Q6P5B0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rrp12Q6P5B0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rrp12Q6P5B0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rrp12Q6P5B0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rrp12Q6P5B0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rrp12Q6P5B0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rrp12Q6P5B0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rrp12Q6P5B0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rrp12Q6P5B0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rrp12Q6P5B0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rrp12Q6P5B0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Rrp12Q6P5B0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rrp12Q6P5B0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rrp12Q6P5B0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rrp12Q6P5B0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rrp12Q6P5B0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rrp12Q6P5B0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rrp12Q6P5B0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rrp12Q6P5B0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rrp12Q6P5B0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rrp12Q6P5B0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rrp12Q6P5B0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rrp12Q6P5B0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rrp12Q6P5B0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rrp12Q6P5B0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rrp12Q6P5B0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rrp12Q6P5B0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rrp12Q6P5B0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Rrp12Q6P5B0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rrp12Q6P5B0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rrp12Q6P5B0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rrp12Q6P5B0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rrp12Q6P5B0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rrp12Q6P5B0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rrp12Q6P5B0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rrp12Q6P5B0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rrp12Q6P5B0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rrp12Q6P5B0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rrp12Q6P5B0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rrp12Q6P5B0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rrp12Q6P5B0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rrp12Q6P5B0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Rrp12Q6P5B0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rrp12Q6P5B0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rrp12Q6P5B0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rrp12Q6P5B0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rrp12Q6P5B0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rrp12Q6P5B0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rrp12Q6P5B0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rrp12Q6P5B0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rrp12Q6P5B0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rrp12Q6P5B0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rrp12Q6P5B0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rrp12Q6P5B0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms