Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4U0

Thsd7b, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd7bQ6P4U0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Thsd7bQ6P4U0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Thsd7bQ6P4U0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Thsd7bQ6P4U0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Thsd7bQ6P4U0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Thsd7bQ6P4U0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Thsd7bQ6P4U0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Thsd7bQ6P4U0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Thsd7bQ6P4U0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Thsd7bQ6P4U0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Thsd7bQ6P4U0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Thsd7bQ6P4U0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Thsd7bQ6P4U0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Thsd7bQ6P4U0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Thsd7bQ6P4U0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Thsd7bQ6P4U0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Thsd7bQ6P4U0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Thsd7bQ6P4U0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Thsd7bQ6P4U0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Thsd7bQ6P4U0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Thsd7bQ6P4U0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Thsd7bQ6P4U0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Thsd7bQ6P4U0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Thsd7bQ6P4U0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Thsd7bQ6P4U0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Thsd7bQ6P4U0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Thsd7bQ6P4U0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Thsd7bQ6P4U0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Thsd7bQ6P4U0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Thsd7bQ6P4U0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Thsd7bQ6P4U0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Thsd7bQ6P4U0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Thsd7bQ6P4U0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Thsd7bQ6P4U0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Thsd7bQ6P4U0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Thsd7bQ6P4U0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Thsd7bQ6P4U0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Thsd7bQ6P4U0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Thsd7bQ6P4U0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Thsd7bQ6P4U0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Thsd7bQ6P4U0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Thsd7bQ6P4U0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Thsd7bQ6P4U0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Thsd7bQ6P4U0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Thsd7bQ6P4U0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Thsd7bQ6P4U0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Thsd7bQ6P4U0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Thsd7bQ6P4U0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Thsd7bQ6P4U0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Thsd7bQ6P4U0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Thsd7bQ6P4U0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Thsd7bQ6P4U0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Thsd7bQ6P4U0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Thsd7bQ6P4U0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Thsd7bQ6P4U0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Thsd7bQ6P4U0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Thsd7bQ6P4U0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Thsd7bQ6P4U0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Thsd7bQ6P4U0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Thsd7bQ6P4U0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Thsd7bQ6P4U0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Thsd7bQ6P4U0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Thsd7bQ6P4U0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Thsd7bQ6P4U0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Thsd7bQ6P4U0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Thsd7bQ6P4U0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Thsd7bQ6P4U0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Thsd7bQ6P4U0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Thsd7bQ6P4U0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Thsd7bQ6P4U0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Thsd7bQ6P4U0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Thsd7bQ6P4U0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Thsd7bQ6P4U0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Thsd7bQ6P4U0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Thsd7bQ6P4U0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Thsd7bQ6P4U0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Thsd7bQ6P4U0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Thsd7bQ6P4U0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Thsd7bQ6P4U0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Thsd7bQ6P4U0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Thsd7bQ6P4U0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Thsd7bQ6P4U0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Thsd7bQ6P4U0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Thsd7bQ6P4U0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Thsd7bQ6P4U0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Thsd7bQ6P4U0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Thsd7bQ6P4U0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Thsd7bQ6P4U0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Thsd7bQ6P4U0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Thsd7bQ6P4U0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Thsd7bQ6P4U0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Thsd7bQ6P4U0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Thsd7bQ6P4U0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Thsd7bQ6P4U0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Thsd7bQ6P4U0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Thsd7bQ6P4U0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Thsd7bQ6P4U0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Thsd7bQ6P4U0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Thsd7bQ6P4U0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Thsd7bQ6P4U0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms