Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Podnl1Q6P3Y9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Podnl1Q6P3Y9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Podnl1Q6P3Y9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Podnl1Q6P3Y9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Podnl1Q6P3Y9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Podnl1Q6P3Y9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Podnl1Q6P3Y9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Podnl1Q6P3Y9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Podnl1Q6P3Y9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Podnl1Q6P3Y9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Podnl1Q6P3Y9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Podnl1Q6P3Y9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Podnl1Q6P3Y9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Podnl1Q6P3Y9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Podnl1Q6P3Y9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Podnl1Q6P3Y9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Podnl1Q6P3Y9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Podnl1Q6P3Y9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Podnl1Q6P3Y9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Podnl1Q6P3Y9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Podnl1Q6P3Y9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Podnl1Q6P3Y9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Podnl1Q6P3Y9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Podnl1Q6P3Y9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Podnl1Q6P3Y9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Podnl1Q6P3Y9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Podnl1Q6P3Y9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Podnl1Q6P3Y9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Podnl1Q6P3Y9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Podnl1Q6P3Y9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Podnl1Q6P3Y9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Podnl1Q6P3Y9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Podnl1Q6P3Y9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Podnl1Q6P3Y9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Podnl1Q6P3Y9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Podnl1Q6P3Y9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Podnl1Q6P3Y9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Podnl1Q6P3Y9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Podnl1Q6P3Y9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Podnl1Q6P3Y9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Podnl1Q6P3Y9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Podnl1Q6P3Y9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Podnl1Q6P3Y9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Podnl1Q6P3Y9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Podnl1Q6P3Y9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Podnl1Q6P3Y9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Podnl1Q6P3Y9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Podnl1Q6P3Y9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Podnl1Q6P3Y9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Podnl1Q6P3Y9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Podnl1Q6P3Y9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Podnl1Q6P3Y9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Podnl1Q6P3Y9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Podnl1Q6P3Y9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Podnl1Q6P3Y9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Podnl1Q6P3Y9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Podnl1Q6P3Y9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Podnl1Q6P3Y9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Podnl1Q6P3Y9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Podnl1Q6P3Y9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Podnl1Q6P3Y9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Podnl1Q6P3Y9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Podnl1Q6P3Y9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Podnl1Q6P3Y9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Podnl1Q6P3Y9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Podnl1Q6P3Y9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Podnl1Q6P3Y9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Podnl1Q6P3Y9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Podnl1Q6P3Y9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Podnl1Q6P3Y9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Podnl1Q6P3Y9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Podnl1Q6P3Y9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Podnl1Q6P3Y9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Podnl1Q6P3Y9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Podnl1Q6P3Y9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Podnl1Q6P3Y9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Podnl1Q6P3Y9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Podnl1Q6P3Y9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Podnl1Q6P3Y9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Podnl1Q6P3Y9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Podnl1Q6P3Y9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Podnl1Q6P3Y9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Podnl1Q6P3Y9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Podnl1Q6P3Y9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Podnl1Q6P3Y9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Podnl1Q6P3Y9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Podnl1Q6P3Y9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Podnl1Q6P3Y9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Podnl1Q6P3Y9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Podnl1Q6P3Y9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Podnl1Q6P3Y9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Podnl1Q6P3Y9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Podnl1Q6P3Y9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Podnl1Q6P3Y9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Podnl1Q6P3Y9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Podnl1Q6P3Y9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Podnl1Q6P3Y9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Podnl1Q6P3Y9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Podnl1Q6P3Y9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms