Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gpbp1l1Q6NZP2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gpbp1l1Q6NZP2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gpbp1l1Q6NZP2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gpbp1l1Q6NZP2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gpbp1l1Q6NZP2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gpbp1l1Q6NZP2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gpbp1l1Q6NZP2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gpbp1l1Q6NZP2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gpbp1l1Q6NZP2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gpbp1l1Q6NZP2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gpbp1l1Q6NZP2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms