Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Soga3Q6NZL0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Soga3Q6NZL0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Soga3Q6NZL0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Soga3Q6NZL0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Soga3Q6NZL0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Soga3Q6NZL0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Soga3Q6NZL0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Soga3Q6NZL0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Soga3Q6NZL0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Soga3Q6NZL0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Soga3Q6NZL0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Soga3Q6NZL0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Soga3Q6NZL0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Soga3Q6NZL0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Soga3Q6NZL0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Soga3Q6NZL0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Soga3Q6NZL0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Soga3Q6NZL0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Soga3Q6NZL0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Soga3Q6NZL0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Soga3Q6NZL0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Soga3Q6NZL0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Soga3Q6NZL0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Soga3Q6NZL0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Soga3Q6NZL0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Soga3Q6NZL0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Soga3Q6NZL0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Soga3Q6NZL0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Soga3Q6NZL0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Soga3Q6NZL0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Soga3Q6NZL0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Soga3Q6NZL0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Soga3Q6NZL0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Soga3Q6NZL0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Soga3Q6NZL0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Soga3Q6NZL0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Soga3Q6NZL0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Soga3Q6NZL0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Soga3Q6NZL0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Soga3Q6NZL0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Soga3Q6NZL0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Soga3Q6NZL0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Soga3Q6NZL0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Soga3Q6NZL0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Soga3Q6NZL0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Soga3Q6NZL0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Soga3Q6NZL0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Soga3Q6NZL0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Soga3Q6NZL0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Soga3Q6NZL0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Soga3Q6NZL0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Soga3Q6NZL0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Soga3Q6NZL0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Soga3Q6NZL0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Soga3Q6NZL0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Soga3Q6NZL0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Soga3Q6NZL0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Soga3Q6NZL0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Soga3Q6NZL0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Soga3Q6NZL0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Soga3Q6NZL0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Soga3Q6NZL0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Soga3Q6NZL0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Soga3Q6NZL0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Soga3Q6NZL0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Soga3Q6NZL0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Soga3Q6NZL0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Soga3Q6NZL0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Soga3Q6NZL0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Soga3Q6NZL0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Soga3Q6NZL0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Soga3Q6NZL0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Soga3Q6NZL0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Soga3Q6NZL0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Soga3Q6NZL0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Soga3Q6NZL0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Soga3Q6NZL0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Soga3Q6NZL0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Soga3Q6NZL0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Soga3Q6NZL0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Soga3Q6NZL0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Soga3Q6NZL0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Soga3Q6NZL0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Soga3Q6NZL0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Soga3Q6NZL0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Soga3Q6NZL0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Soga3Q6NZL0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Soga3Q6NZL0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Soga3Q6NZL0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Soga3Q6NZL0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Soga3Q6NZL0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Soga3Q6NZL0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Soga3Q6NZL0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Soga3Q6NZL0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Soga3Q6NZL0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Soga3Q6NZL0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Soga3Q6NZL0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Soga3Q6NZL0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Soga3Q6NZL0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms