Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZK8

Ptpdc1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpdc1Q6NZK8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ptpdc1Q6NZK8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ptpdc1Q6NZK8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ptpdc1Q6NZK8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ptpdc1Q6NZK8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ptpdc1Q6NZK8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ptpdc1Q6NZK8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ptpdc1Q6NZK8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ptpdc1Q6NZK8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ptpdc1Q6NZK8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ptpdc1Q6NZK8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ptpdc1Q6NZK8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ptpdc1Q6NZK8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ptpdc1Q6NZK8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ptpdc1Q6NZK8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ptpdc1Q6NZK8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ptpdc1Q6NZK8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ptpdc1Q6NZK8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ptpdc1Q6NZK8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ptpdc1Q6NZK8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ptpdc1Q6NZK8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Ptpdc1Q6NZK8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ptpdc1Q6NZK8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ptpdc1Q6NZK8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ptpdc1Q6NZK8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ptpdc1Q6NZK8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ptpdc1Q6NZK8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ptpdc1Q6NZK8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ptpdc1Q6NZK8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ptpdc1Q6NZK8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ptpdc1Q6NZK8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ptpdc1Q6NZK8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ptpdc1Q6NZK8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Ptpdc1Q6NZK8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ptpdc1Q6NZK8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ptpdc1Q6NZK8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ptpdc1Q6NZK8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ptpdc1Q6NZK8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ptpdc1Q6NZK8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ptpdc1Q6NZK8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ptpdc1Q6NZK8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ptpdc1Q6NZK8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ptpdc1Q6NZK8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ptpdc1Q6NZK8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ptpdc1Q6NZK8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ptpdc1Q6NZK8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ptpdc1Q6NZK8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ptpdc1Q6NZK8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ptpdc1Q6NZK8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ptpdc1Q6NZK8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ptpdc1Q6NZK8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ptpdc1Q6NZK8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Ptpdc1Q6NZK8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ptpdc1Q6NZK8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ptpdc1Q6NZK8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ptpdc1Q6NZK8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ptpdc1Q6NZK8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ptpdc1Q6NZK8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ptpdc1Q6NZK8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ptpdc1Q6NZK8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Ptpdc1Q6NZK8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ptpdc1Q6NZK8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ptpdc1Q6NZK8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ptpdc1Q6NZK8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ptpdc1Q6NZK8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ptpdc1Q6NZK8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ptpdc1Q6NZK8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ptpdc1Q6NZK8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ptpdc1Q6NZK8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Ptpdc1Q6NZK8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ptpdc1Q6NZK8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ptpdc1Q6NZK8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ptpdc1Q6NZK8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ptpdc1Q6NZK8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ptpdc1Q6NZK8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ptpdc1Q6NZK8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ptpdc1Q6NZK8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ptpdc1Q6NZK8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ptpdc1Q6NZK8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ptpdc1Q6NZK8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ptpdc1Q6NZK8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ptpdc1Q6NZK8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Ptpdc1Q6NZK8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ptpdc1Q6NZK8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ptpdc1Q6NZK8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ptpdc1Q6NZK8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ptpdc1Q6NZK8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ptpdc1Q6NZK8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Ptpdc1Q6NZK8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ptpdc1Q6NZK8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ptpdc1Q6NZK8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ptpdc1Q6NZK8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ptpdc1Q6NZK8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ptpdc1Q6NZK8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ptpdc1Q6NZK8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ptpdc1Q6NZK8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ptpdc1Q6NZK8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms