Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXZ1

Krba1, Protein KRBA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krba1Q6NXZ1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krba1Q6NXZ1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Krba1Q6NXZ1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krba1Q6NXZ1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krba1Q6NXZ1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krba1Q6NXZ1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krba1Q6NXZ1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krba1Q6NXZ1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Krba1Q6NXZ1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krba1Q6NXZ1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krba1Q6NXZ1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krba1Q6NXZ1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krba1Q6NXZ1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krba1Q6NXZ1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krba1Q6NXZ1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krba1Q6NXZ1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Krba1Q6NXZ1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krba1Q6NXZ1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krba1Q6NXZ1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krba1Q6NXZ1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krba1Q6NXZ1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Krba1Q6NXZ1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krba1Q6NXZ1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krba1Q6NXZ1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krba1Q6NXZ1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krba1Q6NXZ1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krba1Q6NXZ1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krba1Q6NXZ1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Krba1Q6NXZ1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krba1Q6NXZ1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krba1Q6NXZ1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krba1Q6NXZ1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krba1Q6NXZ1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krba1Q6NXZ1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krba1Q6NXZ1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krba1Q6NXZ1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krba1Q6NXZ1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krba1Q6NXZ1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krba1Q6NXZ1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krba1Q6NXZ1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Krba1Q6NXZ1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krba1Q6NXZ1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Krba1Q6NXZ1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krba1Q6NXZ1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krba1Q6NXZ1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krba1Q6NXZ1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krba1Q6NXZ1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krba1Q6NXZ1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krba1Q6NXZ1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krba1Q6NXZ1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krba1Q6NXZ1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krba1Q6NXZ1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krba1Q6NXZ1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krba1Q6NXZ1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krba1Q6NXZ1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krba1Q6NXZ1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krba1Q6NXZ1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krba1Q6NXZ1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krba1Q6NXZ1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krba1Q6NXZ1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krba1Q6NXZ1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krba1Q6NXZ1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krba1Q6NXZ1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krba1Q6NXZ1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krba1Q6NXZ1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krba1Q6NXZ1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krba1Q6NXZ1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krba1Q6NXZ1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krba1Q6NXZ1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krba1Q6NXZ1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krba1Q6NXZ1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Krba1Q6NXZ1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krba1Q6NXZ1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krba1Q6NXZ1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krba1Q6NXZ1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krba1Q6NXZ1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krba1Q6NXZ1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Krba1Q6NXZ1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krba1Q6NXZ1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krba1Q6NXZ1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krba1Q6NXZ1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krba1Q6NXZ1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Krba1Q6NXZ1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krba1Q6NXZ1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krba1Q6NXZ1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krba1Q6NXZ1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Krba1Q6NXZ1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krba1Q6NXZ1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krba1Q6NXZ1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krba1Q6NXZ1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krba1Q6NXZ1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krba1Q6NXZ1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krba1Q6NXZ1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krba1Q6NXZ1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Krba1Q6NXZ1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Krba1Q6NXZ1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krba1Q6NXZ1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krba1Q6NXZ1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krba1Q6NXZ1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Krba1Q6NXZ1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms