Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fndc3bQ6NWW9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fndc3bQ6NWW9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fndc3bQ6NWW9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fndc3bQ6NWW9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fndc3bQ6NWW9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fndc3bQ6NWW9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Fndc3bQ6NWW9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fndc3bQ6NWW9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fndc3bQ6NWW9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fndc3bQ6NWW9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fndc3bQ6NWW9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Fndc3bQ6NWW9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fndc3bQ6NWW9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fndc3bQ6NWW9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Fndc3bQ6NWW9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fndc3bQ6NWW9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fndc3bQ6NWW9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fndc3bQ6NWW9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fndc3bQ6NWW9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fndc3bQ6NWW9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Fndc3bQ6NWW9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fndc3bQ6NWW9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fndc3bQ6NWW9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fndc3bQ6NWW9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fndc3bQ6NWW9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fndc3bQ6NWW9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fndc3bQ6NWW9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fndc3bQ6NWW9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fndc3bQ6NWW9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fndc3bQ6NWW9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fndc3bQ6NWW9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Fndc3bQ6NWW9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fndc3bQ6NWW9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fndc3bQ6NWW9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fndc3bQ6NWW9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fndc3bQ6NWW9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fndc3bQ6NWW9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fndc3bQ6NWW9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fndc3bQ6NWW9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fndc3bQ6NWW9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Fndc3bQ6NWW9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fndc3bQ6NWW9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fndc3bQ6NWW9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fndc3bQ6NWW9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fndc3bQ6NWW9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fndc3bQ6NWW9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fndc3bQ6NWW9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fndc3bQ6NWW9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fndc3bQ6NWW9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fndc3bQ6NWW9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fndc3bQ6NWW9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fndc3bQ6NWW9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fndc3bQ6NWW9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fndc3bQ6NWW9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fndc3bQ6NWW9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Fndc3bQ6NWW9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fndc3bQ6NWW9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fndc3bQ6NWW9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fndc3bQ6NWW9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fndc3bQ6NWW9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fndc3bQ6NWW9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fndc3bQ6NWW9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fndc3bQ6NWW9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fndc3bQ6NWW9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fndc3bQ6NWW9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fndc3bQ6NWW9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Fndc3bQ6NWW9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fndc3bQ6NWW9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fndc3bQ6NWW9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fndc3bQ6NWW9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fndc3bQ6NWW9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fndc3bQ6NWW9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Fndc3bQ6NWW9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fndc3bQ6NWW9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Fndc3bQ6NWW9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fndc3bQ6NWW9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fndc3bQ6NWW9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fndc3bQ6NWW9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fndc3bQ6NWW9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fndc3bQ6NWW9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fndc3bQ6NWW9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fndc3bQ6NWW9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fndc3bQ6NWW9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fndc3bQ6NWW9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fndc3bQ6NWW9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fndc3bQ6NWW9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fndc3bQ6NWW9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fndc3bQ6NWW9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fndc3bQ6NWW9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fndc3bQ6NWW9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fndc3bQ6NWW9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fndc3bQ6NWW9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fndc3bQ6NWW9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fndc3bQ6NWW9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fndc3bQ6NWW9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fndc3bQ6NWW9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fndc3bQ6NWW9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fndc3bQ6NWW9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fndc3bQ6NWW9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms