Protein–RNA interactions for Protein: Q6IR41

C1qtnf6, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf6Q6IR41 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1qtnf6Q6IR41 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1qtnf6Q6IR41 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1qtnf6Q6IR41 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1qtnf6Q6IR41 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1qtnf6Q6IR41 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1qtnf6Q6IR41 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1qtnf6Q6IR41 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1qtnf6Q6IR41 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1qtnf6Q6IR41 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1qtnf6Q6IR41 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C1qtnf6Q6IR41 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1qtnf6Q6IR41 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1qtnf6Q6IR41 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1qtnf6Q6IR41 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1qtnf6Q6IR41 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1qtnf6Q6IR41 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
C1qtnf6Q6IR41 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1qtnf6Q6IR41 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
C1qtnf6Q6IR41 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1qtnf6Q6IR41 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1qtnf6Q6IR41 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1qtnf6Q6IR41 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1qtnf6Q6IR41 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1qtnf6Q6IR41 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1qtnf6Q6IR41 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C1qtnf6Q6IR41 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1qtnf6Q6IR41 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1qtnf6Q6IR41 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1qtnf6Q6IR41 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1qtnf6Q6IR41 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1qtnf6Q6IR41 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C1qtnf6Q6IR41 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1qtnf6Q6IR41 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1qtnf6Q6IR41 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C1qtnf6Q6IR41 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C1qtnf6Q6IR41 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1qtnf6Q6IR41 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C1qtnf6Q6IR41 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1qtnf6Q6IR41 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1qtnf6Q6IR41 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1qtnf6Q6IR41 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1qtnf6Q6IR41 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1qtnf6Q6IR41 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1qtnf6Q6IR41 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1qtnf6Q6IR41 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1qtnf6Q6IR41 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1qtnf6Q6IR41 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1qtnf6Q6IR41 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1qtnf6Q6IR41 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1qtnf6Q6IR41 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1qtnf6Q6IR41 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1qtnf6Q6IR41 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1qtnf6Q6IR41 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1qtnf6Q6IR41 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1qtnf6Q6IR41 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1qtnf6Q6IR41 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1qtnf6Q6IR41 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1qtnf6Q6IR41 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1qtnf6Q6IR41 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1qtnf6Q6IR41 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C1qtnf6Q6IR41 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1qtnf6Q6IR41 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C1qtnf6Q6IR41 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1qtnf6Q6IR41 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1qtnf6Q6IR41 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1qtnf6Q6IR41 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1qtnf6Q6IR41 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1qtnf6Q6IR41 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1qtnf6Q6IR41 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1qtnf6Q6IR41 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1qtnf6Q6IR41 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1qtnf6Q6IR41 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1qtnf6Q6IR41 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C1qtnf6Q6IR41 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C1qtnf6Q6IR41 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C1qtnf6Q6IR41 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C1qtnf6Q6IR41 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1qtnf6Q6IR41 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1qtnf6Q6IR41 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1qtnf6Q6IR41 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1qtnf6Q6IR41 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1qtnf6Q6IR41 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1qtnf6Q6IR41 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1qtnf6Q6IR41 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1qtnf6Q6IR41 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1qtnf6Q6IR41 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
C1qtnf6Q6IR41 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1qtnf6Q6IR41 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1qtnf6Q6IR41 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1qtnf6Q6IR41 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1qtnf6Q6IR41 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1qtnf6Q6IR41 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1qtnf6Q6IR41 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1qtnf6Q6IR41 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1qtnf6Q6IR41 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1qtnf6Q6IR41 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1qtnf6Q6IR41 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1qtnf6Q6IR41 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1qtnf6Q6IR41 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms