Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Krt40Q6IFX3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Krt40Q6IFX3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Krt40Q6IFX3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Krt40Q6IFX3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Krt40Q6IFX3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Krt40Q6IFX3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Krt40Q6IFX3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Krt40Q6IFX3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Krt40Q6IFX3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Krt40Q6IFX3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Krt40Q6IFX3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Krt40Q6IFX3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Krt40Q6IFX3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Krt40Q6IFX3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Krt40Q6IFX3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Krt40Q6IFX3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Krt40Q6IFX3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Krt40Q6IFX3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Krt40Q6IFX3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Krt40Q6IFX3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Krt40Q6IFX3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Krt40Q6IFX3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Krt40Q6IFX3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Krt40Q6IFX3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Krt40Q6IFX3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Krt40Q6IFX3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Krt40Q6IFX3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Krt40Q6IFX3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Krt40Q6IFX3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Krt40Q6IFX3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Krt40Q6IFX3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Krt40Q6IFX3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Krt40Q6IFX3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Krt40Q6IFX3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Krt40Q6IFX3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Krt40Q6IFX3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Krt40Q6IFX3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Krt40Q6IFX3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Krt40Q6IFX3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Krt40Q6IFX3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Krt40Q6IFX3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Krt40Q6IFX3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Krt40Q6IFX3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Krt40Q6IFX3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Krt40Q6IFX3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Krt40Q6IFX3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Krt40Q6IFX3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Krt40Q6IFX3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Krt40Q6IFX3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Krt40Q6IFX3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Krt40Q6IFX3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Krt40Q6IFX3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Krt40Q6IFX3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Krt40Q6IFX3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Krt40Q6IFX3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Krt40Q6IFX3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Krt40Q6IFX3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Krt40Q6IFX3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Krt40Q6IFX3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Krt40Q6IFX3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Krt40Q6IFX3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Krt40Q6IFX3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Krt40Q6IFX3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Krt40Q6IFX3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Krt40Q6IFX3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Krt40Q6IFX3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Krt40Q6IFX3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Krt40Q6IFX3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Krt40Q6IFX3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Krt40Q6IFX3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Krt40Q6IFX3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Krt40Q6IFX3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Krt40Q6IFX3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Krt40Q6IFX3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Krt40Q6IFX3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Krt40Q6IFX3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Krt40Q6IFX3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Krt40Q6IFX3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Krt40Q6IFX3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Krt40Q6IFX3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Krt40Q6IFX3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Krt40Q6IFX3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Krt40Q6IFX3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Krt40Q6IFX3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Krt40Q6IFX3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Krt40Q6IFX3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Krt40Q6IFX3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Krt40Q6IFX3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Krt40Q6IFX3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Krt40Q6IFX3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Krt40Q6IFX3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Krt40Q6IFX3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Krt40Q6IFX3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Krt40Q6IFX3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Krt40Q6IFX3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Krt40Q6IFX3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Krt40Q6IFX3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Krt40Q6IFX3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Krt40Q6IFX3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
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