Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atg9bQ6EBV9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atg9bQ6EBV9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atg9bQ6EBV9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atg9bQ6EBV9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atg9bQ6EBV9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atg9bQ6EBV9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atg9bQ6EBV9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg9bQ6EBV9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg9bQ6EBV9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg9bQ6EBV9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg9bQ6EBV9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg9bQ6EBV9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg9bQ6EBV9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg9bQ6EBV9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg9bQ6EBV9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg9bQ6EBV9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atg9bQ6EBV9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg9bQ6EBV9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg9bQ6EBV9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg9bQ6EBV9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg9bQ6EBV9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atg9bQ6EBV9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg9bQ6EBV9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg9bQ6EBV9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg9bQ6EBV9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg9bQ6EBV9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atg9bQ6EBV9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg9bQ6EBV9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg9bQ6EBV9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg9bQ6EBV9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg9bQ6EBV9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg9bQ6EBV9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atg9bQ6EBV9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg9bQ6EBV9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg9bQ6EBV9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg9bQ6EBV9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg9bQ6EBV9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg9bQ6EBV9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg9bQ6EBV9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atg9bQ6EBV9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg9bQ6EBV9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg9bQ6EBV9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg9bQ6EBV9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg9bQ6EBV9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atg9bQ6EBV9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg9bQ6EBV9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg9bQ6EBV9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg9bQ6EBV9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg9bQ6EBV9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg9bQ6EBV9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg9bQ6EBV9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atg9bQ6EBV9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg9bQ6EBV9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg9bQ6EBV9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg9bQ6EBV9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg9bQ6EBV9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg9bQ6EBV9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg9bQ6EBV9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg9bQ6EBV9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg9bQ6EBV9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg9bQ6EBV9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atg9bQ6EBV9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atg9bQ6EBV9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Atg9bQ6EBV9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atg9bQ6EBV9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Atg9bQ6EBV9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Atg9bQ6EBV9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atg9bQ6EBV9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg9bQ6EBV9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg9bQ6EBV9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg9bQ6EBV9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg9bQ6EBV9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg9bQ6EBV9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg9bQ6EBV9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg9bQ6EBV9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg9bQ6EBV9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atg9bQ6EBV9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atg9bQ6EBV9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atg9bQ6EBV9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atg9bQ6EBV9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atg9bQ6EBV9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg9bQ6EBV9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg9bQ6EBV9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg9bQ6EBV9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg9bQ6EBV9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg9bQ6EBV9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg9bQ6EBV9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg9bQ6EBV9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atg9bQ6EBV9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg9bQ6EBV9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg9bQ6EBV9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg9bQ6EBV9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg9bQ6EBV9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg9bQ6EBV9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg9bQ6EBV9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg9bQ6EBV9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg9bQ6EBV9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atg9bQ6EBV9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atg9bQ6EBV9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms