Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Scaf8Q6DID3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Scaf8Q6DID3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Scaf8Q6DID3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Scaf8Q6DID3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Scaf8Q6DID3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Scaf8Q6DID3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Scaf8Q6DID3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Scaf8Q6DID3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Scaf8Q6DID3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Scaf8Q6DID3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Scaf8Q6DID3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Scaf8Q6DID3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Scaf8Q6DID3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Scaf8Q6DID3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Scaf8Q6DID3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Scaf8Q6DID3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Scaf8Q6DID3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Scaf8Q6DID3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Scaf8Q6DID3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Scaf8Q6DID3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Scaf8Q6DID3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Scaf8Q6DID3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Scaf8Q6DID3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Scaf8Q6DID3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Scaf8Q6DID3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Scaf8Q6DID3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Scaf8Q6DID3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Scaf8Q6DID3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Scaf8Q6DID3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Scaf8Q6DID3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Scaf8Q6DID3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Scaf8Q6DID3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Scaf8Q6DID3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Scaf8Q6DID3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Scaf8Q6DID3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Scaf8Q6DID3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Scaf8Q6DID3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Scaf8Q6DID3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Scaf8Q6DID3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Scaf8Q6DID3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Scaf8Q6DID3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Scaf8Q6DID3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scaf8Q6DID3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scaf8Q6DID3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scaf8Q6DID3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scaf8Q6DID3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scaf8Q6DID3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scaf8Q6DID3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scaf8Q6DID3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Scaf8Q6DID3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Scaf8Q6DID3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Scaf8Q6DID3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Scaf8Q6DID3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Scaf8Q6DID3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Scaf8Q6DID3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Scaf8Q6DID3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Scaf8Q6DID3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Scaf8Q6DID3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Scaf8Q6DID3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Scaf8Q6DID3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Scaf8Q6DID3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Scaf8Q6DID3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Scaf8Q6DID3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Scaf8Q6DID3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Scaf8Q6DID3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Scaf8Q6DID3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Scaf8Q6DID3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Scaf8Q6DID3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Scaf8Q6DID3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Scaf8Q6DID3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Scaf8Q6DID3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Scaf8Q6DID3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Scaf8Q6DID3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Scaf8Q6DID3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Scaf8Q6DID3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Scaf8Q6DID3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Scaf8Q6DID3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Scaf8Q6DID3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Scaf8Q6DID3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Scaf8Q6DID3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Scaf8Q6DID3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Scaf8Q6DID3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Scaf8Q6DID3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Scaf8Q6DID3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Scaf8Q6DID3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Scaf8Q6DID3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Scaf8Q6DID3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Scaf8Q6DID3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Scaf8Q6DID3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Scaf8Q6DID3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Scaf8Q6DID3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Scaf8Q6DID3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Scaf8Q6DID3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Scaf8Q6DID3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Scaf8Q6DID3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Scaf8Q6DID3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Scaf8Q6DID3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scaf8Q6DID3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scaf8Q6DID3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 326.6 ms