Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC39.21■■■■□ 3.87
Smarca2Q6DIC0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Smarca2Q6DIC0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Smarca2Q6DIC0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC39.19■■■■□ 3.86
Smarca2Q6DIC0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
Smarca2Q6DIC0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
Smarca2Q6DIC0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Smarca2Q6DIC0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Smarca2Q6DIC0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
Smarca2Q6DIC0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
Smarca2Q6DIC0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Smarca2Q6DIC0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Smarca2Q6DIC0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC39.15■■■■□ 3.86
Smarca2Q6DIC0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.15■■■■□ 3.86
Smarca2Q6DIC0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Smarca2Q6DIC0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
Smarca2Q6DIC0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
Smarca2Q6DIC0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
Smarca2Q6DIC0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
Smarca2Q6DIC0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Smarca2Q6DIC0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Smarca2Q6DIC0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Smarca2Q6DIC0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC39.11■■■■□ 3.85
Smarca2Q6DIC0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Smarca2Q6DIC0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
Smarca2Q6DIC0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC39.1■■■■□ 3.85
Smarca2Q6DIC0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC39.1■■■■□ 3.85
Smarca2Q6DIC0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Smarca2Q6DIC0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Smarca2Q6DIC0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
Smarca2Q6DIC0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Smarca2Q6DIC0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
Smarca2Q6DIC0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
Smarca2Q6DIC0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Smarca2Q6DIC0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Smarca2Q6DIC0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
Smarca2Q6DIC0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC39.08■■■■□ 3.85
Smarca2Q6DIC0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Smarca2Q6DIC0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Smarca2Q6DIC0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Smarca2Q6DIC0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
Smarca2Q6DIC0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
Smarca2Q6DIC0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
Smarca2Q6DIC0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
Smarca2Q6DIC0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
Smarca2Q6DIC0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
Smarca2Q6DIC0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
Smarca2Q6DIC0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
Smarca2Q6DIC0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
Smarca2Q6DIC0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
Smarca2Q6DIC0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Smarca2Q6DIC0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC39.05■■■■□ 3.84
Smarca2Q6DIC0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
Smarca2Q6DIC0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
Smarca2Q6DIC0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Smarca2Q6DIC0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Smarca2Q6DIC0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC39.04■■■■□ 3.84
Smarca2Q6DIC0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
Smarca2Q6DIC0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
Smarca2Q6DIC0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
Smarca2Q6DIC0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
Smarca2Q6DIC0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
Smarca2Q6DIC0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
Smarca2Q6DIC0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Smarca2Q6DIC0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Smarca2Q6DIC0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Smarca2Q6DIC0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Smarca2Q6DIC0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC39■■■■□ 3.83
Smarca2Q6DIC0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Smarca2Q6DIC0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
Smarca2Q6DIC0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Smarca2Q6DIC0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
Smarca2Q6DIC0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC38.97■■■■□ 3.83
Smarca2Q6DIC0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Smarca2Q6DIC0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
Smarca2Q6DIC0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC38.96■■■■□ 3.83
Smarca2Q6DIC0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
Smarca2Q6DIC0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
Smarca2Q6DIC0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Smarca2Q6DIC0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Smarca2Q6DIC0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Smarca2Q6DIC0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC38.95■■■■□ 3.83
Smarca2Q6DIC0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
Smarca2Q6DIC0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Smarca2Q6DIC0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
Smarca2Q6DIC0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Smarca2Q6DIC0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Smarca2Q6DIC0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
Smarca2Q6DIC0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Smarca2Q6DIC0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
Smarca2Q6DIC0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
Smarca2Q6DIC0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Smarca2Q6DIC0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC38.92■■■■□ 3.82
Smarca2Q6DIC0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Smarca2Q6DIC0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Smarca2Q6DIC0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Smarca2Q6DIC0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
Smarca2Q6DIC0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
Smarca2Q6DIC0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC38.91■■■■□ 3.82
Smarca2Q6DIC0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms