Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cep290Q6A078 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cep290Q6A078 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cep290Q6A078 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cep290Q6A078 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cep290Q6A078 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cep290Q6A078 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cep290Q6A078 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cep290Q6A078 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cep290Q6A078 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cep290Q6A078 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cep290Q6A078 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cep290Q6A078 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cep290Q6A078 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cep290Q6A078 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cep290Q6A078 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cep290Q6A078 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cep290Q6A078 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cep290Q6A078 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cep290Q6A078 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cep290Q6A078 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cep290Q6A078 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cep290Q6A078 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cep290Q6A078 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cep290Q6A078 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cep290Q6A078 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cep290Q6A078 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cep290Q6A078 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cep290Q6A078 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cep290Q6A078 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cep290Q6A078 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cep290Q6A078 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cep290Q6A078 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cep290Q6A078 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cep290Q6A078 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cep290Q6A078 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cep290Q6A078 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cep290Q6A078 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cep290Q6A078 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cep290Q6A078 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cep290Q6A078 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cep290Q6A078 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cep290Q6A078 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cep290Q6A078 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cep290Q6A078 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cep290Q6A078 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cep290Q6A078 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cep290Q6A078 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cep290Q6A078 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cep290Q6A078 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cep290Q6A078 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cep290Q6A078 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cep290Q6A078 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cep290Q6A078 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cep290Q6A078 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cep290Q6A078 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cep290Q6A078 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cep290Q6A078 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cep290Q6A078 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cep290Q6A078 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cep290Q6A078 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cep290Q6A078 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cep290Q6A078 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cep290Q6A078 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cep290Q6A078 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cep290Q6A078 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cep290Q6A078 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cep290Q6A078 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cep290Q6A078 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cep290Q6A078 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cep290Q6A078 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cep290Q6A078 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cep290Q6A078 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cep290Q6A078 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cep290Q6A078 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cep290Q6A078 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cep290Q6A078 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cep290Q6A078 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cep290Q6A078 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cep290Q6A078 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cep290Q6A078 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cep290Q6A078 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cep290Q6A078 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cep290Q6A078 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cep290Q6A078 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cep290Q6A078 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cep290Q6A078 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cep290Q6A078 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cep290Q6A078 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cep290Q6A078 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cep290Q6A078 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cep290Q6A078 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cep290Q6A078 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cep290Q6A078 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cep290Q6A078 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cep290Q6A078 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cep290Q6A078 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cep290Q6A078 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cep290Q6A078 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cep290Q6A078 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
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