Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pkp4Q68FH0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pkp4Q68FH0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Pkp4Q68FH0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pkp4Q68FH0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pkp4Q68FH0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pkp4Q68FH0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pkp4Q68FH0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pkp4Q68FH0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pkp4Q68FH0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pkp4Q68FH0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pkp4Q68FH0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pkp4Q68FH0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pkp4Q68FH0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pkp4Q68FH0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pkp4Q68FH0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pkp4Q68FH0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pkp4Q68FH0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pkp4Q68FH0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkp4Q68FH0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkp4Q68FH0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkp4Q68FH0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkp4Q68FH0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkp4Q68FH0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkp4Q68FH0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkp4Q68FH0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkp4Q68FH0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkp4Q68FH0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkp4Q68FH0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pkp4Q68FH0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkp4Q68FH0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkp4Q68FH0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkp4Q68FH0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkp4Q68FH0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pkp4Q68FH0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pkp4Q68FH0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pkp4Q68FH0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pkp4Q68FH0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pkp4Q68FH0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pkp4Q68FH0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Pkp4Q68FH0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pkp4Q68FH0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pkp4Q68FH0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pkp4Q68FH0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pkp4Q68FH0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pkp4Q68FH0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pkp4Q68FH0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pkp4Q68FH0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pkp4Q68FH0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pkp4Q68FH0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pkp4Q68FH0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pkp4Q68FH0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pkp4Q68FH0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pkp4Q68FH0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pkp4Q68FH0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pkp4Q68FH0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pkp4Q68FH0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pkp4Q68FH0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pkp4Q68FH0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pkp4Q68FH0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pkp4Q68FH0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pkp4Q68FH0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pkp4Q68FH0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pkp4Q68FH0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pkp4Q68FH0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pkp4Q68FH0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pkp4Q68FH0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pkp4Q68FH0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pkp4Q68FH0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pkp4Q68FH0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pkp4Q68FH0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Pkp4Q68FH0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pkp4Q68FH0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pkp4Q68FH0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pkp4Q68FH0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pkp4Q68FH0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pkp4Q68FH0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pkp4Q68FH0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pkp4Q68FH0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pkp4Q68FH0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pkp4Q68FH0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pkp4Q68FH0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pkp4Q68FH0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pkp4Q68FH0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pkp4Q68FH0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pkp4Q68FH0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pkp4Q68FH0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pkp4Q68FH0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pkp4Q68FH0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pkp4Q68FH0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pkp4Q68FH0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pkp4Q68FH0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pkp4Q68FH0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pkp4Q68FH0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pkp4Q68FH0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pkp4Q68FH0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pkp4Q68FH0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Pkp4Q68FH0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pkp4Q68FH0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pkp4Q68FH0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms