Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Sbno1Q689Z5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Sbno1Q689Z5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Sbno1Q689Z5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Sbno1Q689Z5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Sbno1Q689Z5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Sbno1Q689Z5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Sbno1Q689Z5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Sbno1Q689Z5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Sbno1Q689Z5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Sbno1Q689Z5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Sbno1Q689Z5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Sbno1Q689Z5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Sbno1Q689Z5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Sbno1Q689Z5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Sbno1Q689Z5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Sbno1Q689Z5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Sbno1Q689Z5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Sbno1Q689Z5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Sbno1Q689Z5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Sbno1Q689Z5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Sbno1Q689Z5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Sbno1Q689Z5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Sbno1Q689Z5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Sbno1Q689Z5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Sbno1Q689Z5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Sbno1Q689Z5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Sbno1Q689Z5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Sbno1Q689Z5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Sbno1Q689Z5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Sbno1Q689Z5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Sbno1Q689Z5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Sbno1Q689Z5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Sbno1Q689Z5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Sbno1Q689Z5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Sbno1Q689Z5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Sbno1Q689Z5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Sbno1Q689Z5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Sbno1Q689Z5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Sbno1Q689Z5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Sbno1Q689Z5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Sbno1Q689Z5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Sbno1Q689Z5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Sbno1Q689Z5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Sbno1Q689Z5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Sbno1Q689Z5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Sbno1Q689Z5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Sbno1Q689Z5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Sbno1Q689Z5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Sbno1Q689Z5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Sbno1Q689Z5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Sbno1Q689Z5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Sbno1Q689Z5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Sbno1Q689Z5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Sbno1Q689Z5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Sbno1Q689Z5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Sbno1Q689Z5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Sbno1Q689Z5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Sbno1Q689Z5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Sbno1Q689Z5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Sbno1Q689Z5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Sbno1Q689Z5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Sbno1Q689Z5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Sbno1Q689Z5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Sbno1Q689Z5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Sbno1Q689Z5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Sbno1Q689Z5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Sbno1Q689Z5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Sbno1Q689Z5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Sbno1Q689Z5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Sbno1Q689Z5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Sbno1Q689Z5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Sbno1Q689Z5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Sbno1Q689Z5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Sbno1Q689Z5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Sbno1Q689Z5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Sbno1Q689Z5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Sbno1Q689Z5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Sbno1Q689Z5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Sbno1Q689Z5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Sbno1Q689Z5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Sbno1Q689Z5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Sbno1Q689Z5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Sbno1Q689Z5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Sbno1Q689Z5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Sbno1Q689Z5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Sbno1Q689Z5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Sbno1Q689Z5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Sbno1Q689Z5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Sbno1Q689Z5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sbno1Q689Z5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sbno1Q689Z5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sbno1Q689Z5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sbno1Q689Z5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sbno1Q689Z5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sbno1Q689Z5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Sbno1Q689Z5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Sbno1Q689Z5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Sbno1Q689Z5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Sbno1Q689Z5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms