Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CilpQ66K08 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CilpQ66K08 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CilpQ66K08 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CilpQ66K08 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CilpQ66K08 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CilpQ66K08 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CilpQ66K08 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CilpQ66K08 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CilpQ66K08 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CilpQ66K08 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CilpQ66K08 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CilpQ66K08 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CilpQ66K08 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CilpQ66K08 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CilpQ66K08 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CilpQ66K08 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CilpQ66K08 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CilpQ66K08 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CilpQ66K08 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CilpQ66K08 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CilpQ66K08 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CilpQ66K08 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CilpQ66K08 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CilpQ66K08 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CilpQ66K08 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CilpQ66K08 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CilpQ66K08 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CilpQ66K08 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CilpQ66K08 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CilpQ66K08 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CilpQ66K08 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CilpQ66K08 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CilpQ66K08 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CilpQ66K08 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CilpQ66K08 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CilpQ66K08 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CilpQ66K08 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CilpQ66K08 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CilpQ66K08 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CilpQ66K08 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CilpQ66K08 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CilpQ66K08 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CilpQ66K08 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CilpQ66K08 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CilpQ66K08 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CilpQ66K08 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CilpQ66K08 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CilpQ66K08 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CilpQ66K08 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CilpQ66K08 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CilpQ66K08 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CilpQ66K08 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CilpQ66K08 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CilpQ66K08 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CilpQ66K08 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CilpQ66K08 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CilpQ66K08 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CilpQ66K08 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CilpQ66K08 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CilpQ66K08 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CilpQ66K08 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CilpQ66K08 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CilpQ66K08 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CilpQ66K08 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CilpQ66K08 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CilpQ66K08 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CilpQ66K08 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CilpQ66K08 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CilpQ66K08 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CilpQ66K08 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CilpQ66K08 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CilpQ66K08 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CilpQ66K08 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CilpQ66K08 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CilpQ66K08 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CilpQ66K08 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CilpQ66K08 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CilpQ66K08 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CilpQ66K08 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CilpQ66K08 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CilpQ66K08 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CilpQ66K08 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CilpQ66K08 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CilpQ66K08 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CilpQ66K08 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CilpQ66K08 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CilpQ66K08 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CilpQ66K08 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CilpQ66K08 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CilpQ66K08 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CilpQ66K08 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CilpQ66K08 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CilpQ66K08 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CilpQ66K08 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CilpQ66K08 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CilpQ66K08 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CilpQ66K08 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CilpQ66K08 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CilpQ66K08 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms