Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irf4Q64287 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Irf4Q64287 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irf4Q64287 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irf4Q64287 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Irf4Q64287 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irf4Q64287 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irf4Q64287 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irf4Q64287 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irf4Q64287 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irf4Q64287 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irf4Q64287 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Irf4Q64287 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Irf4Q64287 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Irf4Q64287 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Irf4Q64287 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Irf4Q64287 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irf4Q64287 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irf4Q64287 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irf4Q64287 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Irf4Q64287 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Irf4Q64287 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irf4Q64287 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irf4Q64287 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Irf4Q64287 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irf4Q64287 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irf4Q64287 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irf4Q64287 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irf4Q64287 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irf4Q64287 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irf4Q64287 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irf4Q64287 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irf4Q64287 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irf4Q64287 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irf4Q64287 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Irf4Q64287 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irf4Q64287 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irf4Q64287 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Irf4Q64287 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irf4Q64287 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irf4Q64287 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Irf4Q64287 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irf4Q64287 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Irf4Q64287 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irf4Q64287 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irf4Q64287 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Irf4Q64287 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irf4Q64287 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irf4Q64287 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irf4Q64287 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irf4Q64287 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irf4Q64287 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Irf4Q64287 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irf4Q64287 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irf4Q64287 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irf4Q64287 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irf4Q64287 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irf4Q64287 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irf4Q64287 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irf4Q64287 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Irf4Q64287 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irf4Q64287 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irf4Q64287 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irf4Q64287 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irf4Q64287 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Irf4Q64287 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irf4Q64287 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irf4Q64287 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Irf4Q64287 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Irf4Q64287 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Irf4Q64287 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Irf4Q64287 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irf4Q64287 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irf4Q64287 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irf4Q64287 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irf4Q64287 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irf4Q64287 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irf4Q64287 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irf4Q64287 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Irf4Q64287 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irf4Q64287 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irf4Q64287 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Irf4Q64287 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irf4Q64287 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irf4Q64287 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irf4Q64287 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irf4Q64287 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Irf4Q64287 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irf4Q64287 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irf4Q64287 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Irf4Q64287 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Irf4Q64287 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irf4Q64287 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irf4Q64287 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irf4Q64287 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irf4Q64287 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irf4Q64287 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irf4Q64287 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irf4Q64287 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Irf4Q64287 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms