Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col4a5Q63ZW6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col4a5Q63ZW6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col4a5Q63ZW6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col4a5Q63ZW6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col4a5Q63ZW6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col4a5Q63ZW6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col4a5Q63ZW6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col4a5Q63ZW6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col4a5Q63ZW6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Col4a5Q63ZW6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Col4a5Q63ZW6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Col4a5Q63ZW6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Col4a5Q63ZW6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Col4a5Q63ZW6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Col4a5Q63ZW6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Col4a5Q63ZW6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Col4a5Q63ZW6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Col4a5Q63ZW6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Col4a5Q63ZW6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Col4a5Q63ZW6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Col4a5Q63ZW6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Col4a5Q63ZW6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Col4a5Q63ZW6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Col4a5Q63ZW6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Col4a5Q63ZW6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Col4a5Q63ZW6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Col4a5Q63ZW6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Col4a5Q63ZW6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Col4a5Q63ZW6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Col4a5Q63ZW6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Col4a5Q63ZW6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Col4a5Q63ZW6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Col4a5Q63ZW6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Col4a5Q63ZW6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Col4a5Q63ZW6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Col4a5Q63ZW6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Col4a5Q63ZW6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Col4a5Q63ZW6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Col4a5Q63ZW6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Col4a5Q63ZW6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Col4a5Q63ZW6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Col4a5Q63ZW6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Col4a5Q63ZW6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Col4a5Q63ZW6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Col4a5Q63ZW6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Col4a5Q63ZW6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Col4a5Q63ZW6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Col4a5Q63ZW6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Col4a5Q63ZW6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Col4a5Q63ZW6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Col4a5Q63ZW6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Col4a5Q63ZW6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Col4a5Q63ZW6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Col4a5Q63ZW6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Col4a5Q63ZW6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Col4a5Q63ZW6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Col4a5Q63ZW6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Col4a5Q63ZW6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Col4a5Q63ZW6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Col4a5Q63ZW6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Col4a5Q63ZW6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Col4a5Q63ZW6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Col4a5Q63ZW6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Col4a5Q63ZW6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Col4a5Q63ZW6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Col4a5Q63ZW6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Col4a5Q63ZW6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Col4a5Q63ZW6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Col4a5Q63ZW6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Col4a5Q63ZW6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Col4a5Q63ZW6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Col4a5Q63ZW6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Col4a5Q63ZW6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Col4a5Q63ZW6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Col4a5Q63ZW6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Col4a5Q63ZW6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col4a5Q63ZW6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col4a5Q63ZW6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col4a5Q63ZW6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col4a5Q63ZW6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col4a5Q63ZW6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col4a5Q63ZW6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col4a5Q63ZW6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col4a5Q63ZW6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col4a5Q63ZW6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Col4a5Q63ZW6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Col4a5Q63ZW6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Col4a5Q63ZW6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Col4a5Q63ZW6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Col4a5Q63ZW6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Col4a5Q63ZW6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Col4a5Q63ZW6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Col4a5Q63ZW6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Col4a5Q63ZW6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Col4a5Q63ZW6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Col4a5Q63ZW6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Col4a5Q63ZW6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Col4a5Q63ZW6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Col4a5Q63ZW6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms