Protein–RNA interactions for Protein: Q62461

Gm20854, (clone BALB10N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20854Q62461 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm20854Q62461 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm20854Q62461 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm20854Q62461 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm20854Q62461 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20854Q62461 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20854Q62461 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20854Q62461 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20854Q62461 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20854Q62461 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20854Q62461 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20854Q62461 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20854Q62461 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20854Q62461 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20854Q62461 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20854Q62461 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20854Q62461 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20854Q62461 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20854Q62461 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20854Q62461 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20854Q62461 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20854Q62461 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20854Q62461 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20854Q62461 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20854Q62461 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20854Q62461 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20854Q62461 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20854Q62461 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20854Q62461 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20854Q62461 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20854Q62461 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20854Q62461 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20854Q62461 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20854Q62461 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20854Q62461 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20854Q62461 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20854Q62461 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20854Q62461 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20854Q62461 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20854Q62461 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20854Q62461 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20854Q62461 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20854Q62461 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20854Q62461 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20854Q62461 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20854Q62461 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20854Q62461 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20854Q62461 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20854Q62461 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20854Q62461 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20854Q62461 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20854Q62461 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20854Q62461 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20854Q62461 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20854Q62461 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20854Q62461 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20854Q62461 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20854Q62461 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20854Q62461 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20854Q62461 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20854Q62461 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20854Q62461 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm20854Q62461 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm20854Q62461 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20854Q62461 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20854Q62461 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20854Q62461 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20854Q62461 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20854Q62461 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20854Q62461 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20854Q62461 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20854Q62461 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20854Q62461 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20854Q62461 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20854Q62461 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gm20854Q62461 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20854Q62461 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20854Q62461 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20854Q62461 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20854Q62461 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20854Q62461 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20854Q62461 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20854Q62461 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20854Q62461 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20854Q62461 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20854Q62461 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20854Q62461 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20854Q62461 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20854Q62461 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20854Q62461 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20854Q62461 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20854Q62461 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20854Q62461 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20854Q62461 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20854Q62461 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20854Q62461 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20854Q62461 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20854Q62461 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20854Q62461 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm20854Q62461 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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