Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sp4Q62445 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sp4Q62445 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sp4Q62445 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sp4Q62445 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sp4Q62445 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sp4Q62445 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sp4Q62445 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sp4Q62445 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sp4Q62445 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sp4Q62445 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sp4Q62445 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Sp4Q62445 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sp4Q62445 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sp4Q62445 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Sp4Q62445 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sp4Q62445 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sp4Q62445 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sp4Q62445 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sp4Q62445 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sp4Q62445 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sp4Q62445 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sp4Q62445 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sp4Q62445 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sp4Q62445 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Sp4Q62445 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Sp4Q62445 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sp4Q62445 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sp4Q62445 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sp4Q62445 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sp4Q62445 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sp4Q62445 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sp4Q62445 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sp4Q62445 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sp4Q62445 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sp4Q62445 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Sp4Q62445 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sp4Q62445 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Sp4Q62445 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sp4Q62445 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sp4Q62445 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sp4Q62445 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sp4Q62445 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sp4Q62445 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sp4Q62445 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sp4Q62445 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sp4Q62445 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sp4Q62445 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sp4Q62445 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sp4Q62445 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Sp4Q62445 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sp4Q62445 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sp4Q62445 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sp4Q62445 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sp4Q62445 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sp4Q62445 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Sp4Q62445 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Sp4Q62445 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sp4Q62445 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Sp4Q62445 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Sp4Q62445 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sp4Q62445 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Sp4Q62445 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sp4Q62445 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sp4Q62445 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sp4Q62445 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sp4Q62445 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sp4Q62445 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sp4Q62445 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sp4Q62445 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sp4Q62445 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sp4Q62445 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sp4Q62445 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sp4Q62445 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sp4Q62445 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sp4Q62445 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sp4Q62445 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sp4Q62445 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Sp4Q62445 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sp4Q62445 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sp4Q62445 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sp4Q62445 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sp4Q62445 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sp4Q62445 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sp4Q62445 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sp4Q62445 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sp4Q62445 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sp4Q62445 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sp4Q62445 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Sp4Q62445 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sp4Q62445 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sp4Q62445 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sp4Q62445 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sp4Q62445 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sp4Q62445 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Sp4Q62445 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sp4Q62445 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sp4Q62445 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sp4Q62445 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sp4Q62445 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms