Protein–RNA interactions for Protein: Q62420

Sh3gl2, Endophilin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3gl2Q62420 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3gl2Q62420 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3gl2Q62420 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh3gl2Q62420 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3gl2Q62420 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3gl2Q62420 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3gl2Q62420 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3gl2Q62420 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3gl2Q62420 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3gl2Q62420 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3gl2Q62420 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3gl2Q62420 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3gl2Q62420 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3gl2Q62420 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3gl2Q62420 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh3gl2Q62420 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3gl2Q62420 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3gl2Q62420 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3gl2Q62420 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3gl2Q62420 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3gl2Q62420 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3gl2Q62420 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh3gl2Q62420 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3gl2Q62420 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3gl2Q62420 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3gl2Q62420 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh3gl2Q62420 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3gl2Q62420 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3gl2Q62420 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3gl2Q62420 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh3gl2Q62420 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3gl2Q62420 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3gl2Q62420 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3gl2Q62420 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh3gl2Q62420 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3gl2Q62420 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3gl2Q62420 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3gl2Q62420 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3gl2Q62420 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh3gl2Q62420 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sh3gl2Q62420 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sh3gl2Q62420 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sh3gl2Q62420 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sh3gl2Q62420 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3gl2Q62420 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3gl2Q62420 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh3gl2Q62420 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3gl2Q62420 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3gl2Q62420 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3gl2Q62420 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3gl2Q62420 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sh3gl2Q62420 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3gl2Q62420 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3gl2Q62420 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3gl2Q62420 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3gl2Q62420 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3gl2Q62420 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3gl2Q62420 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3gl2Q62420 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3gl2Q62420 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3gl2Q62420 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3gl2Q62420 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3gl2Q62420 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3gl2Q62420 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3gl2Q62420 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3gl2Q62420 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh3gl2Q62420 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh3gl2Q62420 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh3gl2Q62420 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh3gl2Q62420 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh3gl2Q62420 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh3gl2Q62420 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh3gl2Q62420 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh3gl2Q62420 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3gl2Q62420 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3gl2Q62420 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3gl2Q62420 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3gl2Q62420 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3gl2Q62420 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3gl2Q62420 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3gl2Q62420 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3gl2Q62420 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3gl2Q62420 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3gl2Q62420 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3gl2Q62420 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3gl2Q62420 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3gl2Q62420 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3gl2Q62420 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3gl2Q62420 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3gl2Q62420 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3gl2Q62420 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3gl2Q62420 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3gl2Q62420 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3gl2Q62420 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3gl2Q62420 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3gl2Q62420 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3gl2Q62420 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3gl2Q62420 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3gl2Q62420 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3gl2Q62420 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms