Protein–RNA interactions for Protein: Q62395

Tff3, Trefoil factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff3Q62395 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tff3Q62395 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tff3Q62395 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tff3Q62395 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tff3Q62395 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tff3Q62395 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tff3Q62395 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tff3Q62395 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tff3Q62395 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tff3Q62395 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tff3Q62395 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tff3Q62395 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tff3Q62395 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tff3Q62395 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tff3Q62395 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tff3Q62395 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tff3Q62395 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tff3Q62395 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tff3Q62395 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tff3Q62395 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tff3Q62395 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tff3Q62395 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tff3Q62395 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tff3Q62395 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tff3Q62395 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tff3Q62395 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tff3Q62395 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tff3Q62395 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tff3Q62395 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tff3Q62395 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tff3Q62395 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tff3Q62395 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tff3Q62395 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tff3Q62395 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tff3Q62395 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tff3Q62395 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tff3Q62395 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tff3Q62395 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tff3Q62395 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tff3Q62395 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tff3Q62395 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tff3Q62395 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tff3Q62395 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tff3Q62395 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tff3Q62395 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tff3Q62395 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tff3Q62395 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tff3Q62395 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tff3Q62395 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tff3Q62395 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tff3Q62395 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tff3Q62395 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tff3Q62395 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tff3Q62395 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tff3Q62395 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tff3Q62395 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tff3Q62395 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tff3Q62395 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tff3Q62395 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tff3Q62395 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tff3Q62395 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tff3Q62395 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tff3Q62395 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tff3Q62395 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tff3Q62395 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tff3Q62395 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tff3Q62395 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tff3Q62395 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tff3Q62395 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tff3Q62395 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tff3Q62395 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tff3Q62395 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tff3Q62395 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Tff3Q62395 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tff3Q62395 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tff3Q62395 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tff3Q62395 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tff3Q62395 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tff3Q62395 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tff3Q62395 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Tff3Q62395 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tff3Q62395 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tff3Q62395 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tff3Q62395 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tff3Q62395 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tff3Q62395 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tff3Q62395 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Tff3Q62395 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tff3Q62395 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Tff3Q62395 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tff3Q62395 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tff3Q62395 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tff3Q62395 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tff3Q62395 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tff3Q62395 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tff3Q62395 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tff3Q62395 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tff3Q62395 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tff3Q62395 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tff3Q62395 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms