Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tpd52Q62393 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Tpd52Q62393 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tpd52Q62393 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tpd52Q62393 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tpd52Q62393 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tpd52Q62393 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tpd52Q62393 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tpd52Q62393 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tpd52Q62393 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tpd52Q62393 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tpd52Q62393 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tpd52Q62393 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tpd52Q62393 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tpd52Q62393 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Tpd52Q62393 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tpd52Q62393 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tpd52Q62393 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Tpd52Q62393 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tpd52Q62393 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tpd52Q62393 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tpd52Q62393 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Tpd52Q62393 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tpd52Q62393 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tpd52Q62393 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tpd52Q62393 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tpd52Q62393 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tpd52Q62393 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tpd52Q62393 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tpd52Q62393 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tpd52Q62393 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpd52Q62393 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpd52Q62393 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpd52Q62393 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpd52Q62393 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpd52Q62393 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpd52Q62393 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tpd52Q62393 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tpd52Q62393 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tpd52Q62393 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tpd52Q62393 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tpd52Q62393 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tpd52Q62393 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tpd52Q62393 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tpd52Q62393 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tpd52Q62393 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tpd52Q62393 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tpd52Q62393 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tpd52Q62393 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tpd52Q62393 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tpd52Q62393 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tpd52Q62393 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tpd52Q62393 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tpd52Q62393 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tpd52Q62393 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tpd52Q62393 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tpd52Q62393 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tpd52Q62393 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tpd52Q62393 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tpd52Q62393 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tpd52Q62393 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tpd52Q62393 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpd52Q62393 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpd52Q62393 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpd52Q62393 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpd52Q62393 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpd52Q62393 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tpd52Q62393 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tpd52Q62393 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Tpd52Q62393 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tpd52Q62393 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpd52Q62393 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpd52Q62393 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpd52Q62393 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpd52Q62393 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpd52Q62393 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tpd52Q62393 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tpd52Q62393 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tpd52Q62393 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tpd52Q62393 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tpd52Q62393 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tpd52Q62393 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tpd52Q62393 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tpd52Q62393 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tpd52Q62393 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tpd52Q62393 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tpd52Q62393 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tpd52Q62393 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Tpd52Q62393 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tpd52Q62393 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tpd52Q62393 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tpd52Q62393 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tpd52Q62393 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tpd52Q62393 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Tpd52Q62393 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tpd52Q62393 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tpd52Q62393 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tpd52Q62393 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tpd52Q62393 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tpd52Q62393 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms