Protein–RNA interactions for Protein: Q62384

Zpr1, Zinc finger protein ZPR1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zpr1Q62384 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Zpr1Q62384 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Zpr1Q62384 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Zpr1Q62384 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Zpr1Q62384 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Zpr1Q62384 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Zpr1Q62384 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Zpr1Q62384 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Zpr1Q62384 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Zpr1Q62384 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Zpr1Q62384 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Zpr1Q62384 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Zpr1Q62384 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Zpr1Q62384 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Zpr1Q62384 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Zpr1Q62384 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Zpr1Q62384 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Zpr1Q62384 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Zpr1Q62384 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Zpr1Q62384 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Zpr1Q62384 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Zpr1Q62384 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Zpr1Q62384 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Zpr1Q62384 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Zpr1Q62384 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Zpr1Q62384 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Zpr1Q62384 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Zpr1Q62384 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Zpr1Q62384 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Zpr1Q62384 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Zpr1Q62384 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Zpr1Q62384 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Zpr1Q62384 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Zpr1Q62384 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Zpr1Q62384 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Zpr1Q62384 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Zpr1Q62384 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Zpr1Q62384 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Zpr1Q62384 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Zpr1Q62384 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Zpr1Q62384 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Zpr1Q62384 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Zpr1Q62384 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Zpr1Q62384 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Zpr1Q62384 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Zpr1Q62384 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Zpr1Q62384 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Zpr1Q62384 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Zpr1Q62384 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Zpr1Q62384 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Zpr1Q62384 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Zpr1Q62384 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Zpr1Q62384 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Zpr1Q62384 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Zpr1Q62384 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Zpr1Q62384 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Zpr1Q62384 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Zpr1Q62384 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Zpr1Q62384 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Zpr1Q62384 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Zpr1Q62384 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Zpr1Q62384 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Zpr1Q62384 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Zpr1Q62384 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Zpr1Q62384 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Zpr1Q62384 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Zpr1Q62384 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Zpr1Q62384 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Zpr1Q62384 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Zpr1Q62384 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Zpr1Q62384 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Zpr1Q62384 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Zpr1Q62384 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Zpr1Q62384 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Zpr1Q62384 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Zpr1Q62384 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Zpr1Q62384 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Zpr1Q62384 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Zpr1Q62384 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Zpr1Q62384 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Zpr1Q62384 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Zpr1Q62384 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Zpr1Q62384 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Zpr1Q62384 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Zpr1Q62384 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Zpr1Q62384 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Zpr1Q62384 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Zpr1Q62384 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Zpr1Q62384 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Zpr1Q62384 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Zpr1Q62384 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Zpr1Q62384 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Zpr1Q62384 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Zpr1Q62384 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Zpr1Q62384 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Zpr1Q62384 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Zpr1Q62384 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Zpr1Q62384 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Zpr1Q62384 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Zpr1Q62384 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms