Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim28Q62318 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trim28Q62318 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trim28Q62318 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trim28Q62318 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trim28Q62318 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trim28Q62318 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trim28Q62318 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trim28Q62318 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Trim28Q62318 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trim28Q62318 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trim28Q62318 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Trim28Q62318 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trim28Q62318 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trim28Q62318 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trim28Q62318 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trim28Q62318 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trim28Q62318 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trim28Q62318 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trim28Q62318 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Trim28Q62318 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Trim28Q62318 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Trim28Q62318 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Trim28Q62318 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Trim28Q62318 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Trim28Q62318 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Trim28Q62318 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Trim28Q62318 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Trim28Q62318 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trim28Q62318 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trim28Q62318 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trim28Q62318 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trim28Q62318 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trim28Q62318 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trim28Q62318 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Trim28Q62318 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Trim28Q62318 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Trim28Q62318 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Trim28Q62318 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Trim28Q62318 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Trim28Q62318 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Trim28Q62318 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trim28Q62318 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trim28Q62318 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trim28Q62318 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trim28Q62318 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trim28Q62318 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trim28Q62318 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trim28Q62318 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trim28Q62318 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trim28Q62318 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trim28Q62318 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trim28Q62318 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trim28Q62318 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trim28Q62318 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trim28Q62318 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trim28Q62318 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trim28Q62318 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trim28Q62318 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trim28Q62318 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trim28Q62318 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Trim28Q62318 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Trim28Q62318 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Trim28Q62318 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Trim28Q62318 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Trim28Q62318 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Trim28Q62318 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trim28Q62318 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trim28Q62318 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Trim28Q62318 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trim28Q62318 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trim28Q62318 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trim28Q62318 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trim28Q62318 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trim28Q62318 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trim28Q62318 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trim28Q62318 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trim28Q62318 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trim28Q62318 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trim28Q62318 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trim28Q62318 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trim28Q62318 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Trim28Q62318 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trim28Q62318 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trim28Q62318 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Trim28Q62318 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Trim28Q62318 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Trim28Q62318 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trim28Q62318 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trim28Q62318 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trim28Q62318 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Trim28Q62318 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trim28Q62318 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trim28Q62318 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trim28Q62318 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trim28Q62318 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trim28Q62318 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trim28Q62318 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trim28Q62318 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Trim28Q62318 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trim28Q62318 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
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