Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Sall3Q62255 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Sall3Q62255 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Sall3Q62255 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Sall3Q62255 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Sall3Q62255 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Sall3Q62255 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Sall3Q62255 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Sall3Q62255 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Sall3Q62255 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Sall3Q62255 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Sall3Q62255 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Sall3Q62255 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Sall3Q62255 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Sall3Q62255 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Sall3Q62255 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Sall3Q62255 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Sall3Q62255 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Sall3Q62255 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Sall3Q62255 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Sall3Q62255 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Sall3Q62255 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Sall3Q62255 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Sall3Q62255 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Sall3Q62255 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Sall3Q62255 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Sall3Q62255 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Sall3Q62255 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Sall3Q62255 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Sall3Q62255 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Sall3Q62255 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Sall3Q62255 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Sall3Q62255 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Sall3Q62255 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Sall3Q62255 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Sall3Q62255 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Sall3Q62255 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Sall3Q62255 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Sall3Q62255 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Sall3Q62255 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Sall3Q62255 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Sall3Q62255 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Sall3Q62255 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Sall3Q62255 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Sall3Q62255 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Sall3Q62255 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Sall3Q62255 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Sall3Q62255 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Sall3Q62255 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Sall3Q62255 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Sall3Q62255 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Sall3Q62255 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Sall3Q62255 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Sall3Q62255 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Sall3Q62255 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Sall3Q62255 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Sall3Q62255 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Sall3Q62255 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Sall3Q62255 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Sall3Q62255 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Sall3Q62255 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Sall3Q62255 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Sall3Q62255 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Sall3Q62255 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Sall3Q62255 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Sall3Q62255 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Sall3Q62255 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Sall3Q62255 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Sall3Q62255 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.52
Sall3Q62255 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Sall3Q62255 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Sall3Q62255 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Sall3Q62255 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Sall3Q62255 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Sall3Q62255 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Sall3Q62255 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Sall3Q62255 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Sall3Q62255 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Sall3Q62255 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Sall3Q62255 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Sall3Q62255 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Sall3Q62255 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Sall3Q62255 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Sall3Q62255 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Sall3Q62255 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Sall3Q62255 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Sall3Q62255 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Sall3Q62255 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Sall3Q62255 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Sall3Q62255 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Sall3Q62255 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Sall3Q62255 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Sall3Q62255 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Sall3Q62255 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Sall3Q62255 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Sall3Q62255 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Sall3Q62255 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Sall3Q62255 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Sall3Q62255 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Sall3Q62255 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms