Protein–RNA interactions for Protein: Q62245

Sos1, Son of sevenless homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sos1Q62245 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sos1Q62245 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Sos1Q62245 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sos1Q62245 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sos1Q62245 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sos1Q62245 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Sos1Q62245 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Sos1Q62245 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Sos1Q62245 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sos1Q62245 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sos1Q62245 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sos1Q62245 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sos1Q62245 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sos1Q62245 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sos1Q62245 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sos1Q62245 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sos1Q62245 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sos1Q62245 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sos1Q62245 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Sos1Q62245 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sos1Q62245 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sos1Q62245 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sos1Q62245 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sos1Q62245 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sos1Q62245 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sos1Q62245 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sos1Q62245 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Sos1Q62245 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sos1Q62245 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sos1Q62245 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sos1Q62245 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sos1Q62245 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Sos1Q62245 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sos1Q62245 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sos1Q62245 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sos1Q62245 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sos1Q62245 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sos1Q62245 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sos1Q62245 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sos1Q62245 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sos1Q62245 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sos1Q62245 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sos1Q62245 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sos1Q62245 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sos1Q62245 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sos1Q62245 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sos1Q62245 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sos1Q62245 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sos1Q62245 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sos1Q62245 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Sos1Q62245 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sos1Q62245 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sos1Q62245 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sos1Q62245 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sos1Q62245 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sos1Q62245 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Sos1Q62245 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Sos1Q62245 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sos1Q62245 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sos1Q62245 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sos1Q62245 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Sos1Q62245 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sos1Q62245 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sos1Q62245 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sos1Q62245 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sos1Q62245 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sos1Q62245 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sos1Q62245 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Sos1Q62245 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Sos1Q62245 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sos1Q62245 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sos1Q62245 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sos1Q62245 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sos1Q62245 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sos1Q62245 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sos1Q62245 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sos1Q62245 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sos1Q62245 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sos1Q62245 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sos1Q62245 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sos1Q62245 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sos1Q62245 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sos1Q62245 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sos1Q62245 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sos1Q62245 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sos1Q62245 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sos1Q62245 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sos1Q62245 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sos1Q62245 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sos1Q62245 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sos1Q62245 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sos1Q62245 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sos1Q62245 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sos1Q62245 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Sos1Q62245 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Sos1Q62245 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Sos1Q62245 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sos1Q62245 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Sos1Q62245 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sos1Q62245 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms