Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
Kdm5dQ62240 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC41.92■■■■■ 4.3
Kdm5dQ62240 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.92■■■■■ 4.3
Kdm5dQ62240 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
Kdm5dQ62240 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
Kdm5dQ62240 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
Kdm5dQ62240 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
Kdm5dQ62240 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC41.91■■■■■ 4.3
Kdm5dQ62240 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC41.91■■■■■ 4.3
Kdm5dQ62240 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
Kdm5dQ62240 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
Kdm5dQ62240 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC41.9■■■■■ 4.3
Kdm5dQ62240 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC41.9■■■■■ 4.3
Kdm5dQ62240 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC41.9■■■■■ 4.3
Kdm5dQ62240 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC41.9■■■■■ 4.3
Kdm5dQ62240 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
Kdm5dQ62240 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
Kdm5dQ62240 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC41.89■■■■■ 4.3
Kdm5dQ62240 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC41.89■■■■■ 4.3
Kdm5dQ62240 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC41.88■■■■■ 4.29
Kdm5dQ62240 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
Kdm5dQ62240 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.85■■■■■ 4.29
Kdm5dQ62240 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC41.85■■■■■ 4.29
Kdm5dQ62240 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
Kdm5dQ62240 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
Kdm5dQ62240 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
Kdm5dQ62240 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
Kdm5dQ62240 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
Kdm5dQ62240 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
Kdm5dQ62240 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
Kdm5dQ62240 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC41.81■■■■■ 4.28
Kdm5dQ62240 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
Kdm5dQ62240 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
Kdm5dQ62240 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
Kdm5dQ62240 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC41.78■■■■■ 4.28
Kdm5dQ62240 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
Kdm5dQ62240 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
Kdm5dQ62240 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
Kdm5dQ62240 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
Kdm5dQ62240 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
Kdm5dQ62240 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC41.77■■■■■ 4.28
Kdm5dQ62240 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
Kdm5dQ62240 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
Kdm5dQ62240 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC41.76■■■■■ 4.28
Kdm5dQ62240 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
Kdm5dQ62240 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC41.75■■■■■ 4.27
Kdm5dQ62240 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC41.75■■■■■ 4.27
Kdm5dQ62240 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
Kdm5dQ62240 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC41.74■■■■■ 4.27
Kdm5dQ62240 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
Kdm5dQ62240 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
Kdm5dQ62240 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC41.73■■■■■ 4.27
Kdm5dQ62240 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC41.72■■■■■ 4.27
Kdm5dQ62240 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
Kdm5dQ62240 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
Kdm5dQ62240 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC41.71■■■■■ 4.27
Kdm5dQ62240 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
Kdm5dQ62240 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
Kdm5dQ62240 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
Kdm5dQ62240 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
Kdm5dQ62240 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
Kdm5dQ62240 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC41.69■■■■■ 4.26
Kdm5dQ62240 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC41.69■■■■■ 4.26
Kdm5dQ62240 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.26
Kdm5dQ62240 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
Kdm5dQ62240 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
Kdm5dQ62240 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
Kdm5dQ62240 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
Kdm5dQ62240 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC41.68■■■■■ 4.26
Kdm5dQ62240 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
Kdm5dQ62240 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
Kdm5dQ62240 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
Kdm5dQ62240 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
Kdm5dQ62240 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC41.65■■■■■ 4.26
Kdm5dQ62240 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
Kdm5dQ62240 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
Kdm5dQ62240 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
Kdm5dQ62240 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
Kdm5dQ62240 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
Kdm5dQ62240 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC41.65■■■■■ 4.26
Kdm5dQ62240 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
Kdm5dQ62240 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
Kdm5dQ62240 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
Kdm5dQ62240 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
Kdm5dQ62240 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC41.63■■■■■ 4.26
Kdm5dQ62240 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
Kdm5dQ62240 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
Kdm5dQ62240 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
Kdm5dQ62240 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
Kdm5dQ62240 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
Kdm5dQ62240 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
Kdm5dQ62240 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.62■■■■■ 4.25
Kdm5dQ62240 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC41.62■■■■■ 4.25
Kdm5dQ62240 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC41.62■■■■■ 4.25
Kdm5dQ62240 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC41.62■■■■■ 4.25
Kdm5dQ62240 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
Kdm5dQ62240 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC41.61■■■■■ 4.25
Kdm5dQ62240 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
Kdm5dQ62240 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.61■■■■■ 4.25
Kdm5dQ62240 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms