Protein–RNA interactions for Protein: Q62205

Scn9a, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn9aQ62205 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Scn9aQ62205 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Scn9aQ62205 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Scn9aQ62205 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Scn9aQ62205 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Scn9aQ62205 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Scn9aQ62205 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Scn9aQ62205 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Scn9aQ62205 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Scn9aQ62205 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Scn9aQ62205 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Scn9aQ62205 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Scn9aQ62205 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Scn9aQ62205 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Scn9aQ62205 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Scn9aQ62205 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Scn9aQ62205 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Scn9aQ62205 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Scn9aQ62205 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Scn9aQ62205 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Scn9aQ62205 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Scn9aQ62205 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Scn9aQ62205 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Scn9aQ62205 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Scn9aQ62205 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Scn9aQ62205 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Scn9aQ62205 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Scn9aQ62205 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Scn9aQ62205 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Scn9aQ62205 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Scn9aQ62205 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Scn9aQ62205 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Scn9aQ62205 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Scn9aQ62205 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Scn9aQ62205 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Scn9aQ62205 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Scn9aQ62205 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Scn9aQ62205 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Scn9aQ62205 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Scn9aQ62205 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Scn9aQ62205 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Scn9aQ62205 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Scn9aQ62205 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Scn9aQ62205 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Scn9aQ62205 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Scn9aQ62205 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Scn9aQ62205 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Scn9aQ62205 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Scn9aQ62205 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Scn9aQ62205 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Scn9aQ62205 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Scn9aQ62205 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Scn9aQ62205 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Scn9aQ62205 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Scn9aQ62205 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Scn9aQ62205 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Scn9aQ62205 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Scn9aQ62205 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Scn9aQ62205 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Scn9aQ62205 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Scn9aQ62205 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Scn9aQ62205 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Scn9aQ62205 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Scn9aQ62205 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Scn9aQ62205 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Scn9aQ62205 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Scn9aQ62205 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Scn9aQ62205 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Scn9aQ62205 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Scn9aQ62205 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Scn9aQ62205 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Scn9aQ62205 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Scn9aQ62205 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Scn9aQ62205 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Scn9aQ62205 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Scn9aQ62205 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Scn9aQ62205 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Scn9aQ62205 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Scn9aQ62205 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Scn9aQ62205 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Scn9aQ62205 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Scn9aQ62205 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Scn9aQ62205 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Scn9aQ62205 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Scn9aQ62205 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Scn9aQ62205 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Scn9aQ62205 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Scn9aQ62205 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Scn9aQ62205 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Scn9aQ62205 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Scn9aQ62205 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Scn9aQ62205 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Scn9aQ62205 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Scn9aQ62205 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Scn9aQ62205 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Scn9aQ62205 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Scn9aQ62205 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Scn9aQ62205 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Scn9aQ62205 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Scn9aQ62205 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms