Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema3cQ62181 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema3cQ62181 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sema3cQ62181 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema3cQ62181 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema3cQ62181 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema3cQ62181 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema3cQ62181 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema3cQ62181 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sema3cQ62181 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema3cQ62181 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema3cQ62181 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sema3cQ62181 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema3cQ62181 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema3cQ62181 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema3cQ62181 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema3cQ62181 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema3cQ62181 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema3cQ62181 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sema3cQ62181 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sema3cQ62181 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sema3cQ62181 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Sema3cQ62181 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sema3cQ62181 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sema3cQ62181 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sema3cQ62181 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sema3cQ62181 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sema3cQ62181 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema3cQ62181 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema3cQ62181 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema3cQ62181 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema3cQ62181 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema3cQ62181 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema3cQ62181 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sema3cQ62181 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema3cQ62181 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema3cQ62181 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema3cQ62181 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema3cQ62181 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema3cQ62181 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema3cQ62181 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema3cQ62181 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema3cQ62181 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema3cQ62181 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sema3cQ62181 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema3cQ62181 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema3cQ62181 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema3cQ62181 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sema3cQ62181 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema3cQ62181 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema3cQ62181 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema3cQ62181 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sema3cQ62181 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema3cQ62181 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema3cQ62181 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema3cQ62181 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema3cQ62181 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema3cQ62181 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema3cQ62181 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema3cQ62181 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema3cQ62181 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema3cQ62181 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema3cQ62181 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sema3cQ62181 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sema3cQ62181 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sema3cQ62181 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sema3cQ62181 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Sema3cQ62181 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema3cQ62181 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema3cQ62181 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema3cQ62181 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sema3cQ62181 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema3cQ62181 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema3cQ62181 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema3cQ62181 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema3cQ62181 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema3cQ62181 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sema3cQ62181 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema3cQ62181 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema3cQ62181 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema3cQ62181 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema3cQ62181 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema3cQ62181 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sema3cQ62181 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema3cQ62181 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema3cQ62181 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema3cQ62181 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema3cQ62181 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema3cQ62181 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema3cQ62181 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema3cQ62181 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema3cQ62181 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema3cQ62181 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sema3cQ62181 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema3cQ62181 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema3cQ62181 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema3cQ62181 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema3cQ62181 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema3cQ62181 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sema3cQ62181 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms