Protein–RNA interactions for Protein: Q62167

Ddx3x, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx3xQ62167 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddx3xQ62167 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddx3xQ62167 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddx3xQ62167 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddx3xQ62167 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddx3xQ62167 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddx3xQ62167 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddx3xQ62167 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddx3xQ62167 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddx3xQ62167 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddx3xQ62167 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddx3xQ62167 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddx3xQ62167 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddx3xQ62167 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ddx3xQ62167 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ddx3xQ62167 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ddx3xQ62167 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ddx3xQ62167 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ddx3xQ62167 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ddx3xQ62167 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ddx3xQ62167 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ddx3xQ62167 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ddx3xQ62167 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ddx3xQ62167 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddx3xQ62167 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddx3xQ62167 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddx3xQ62167 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddx3xQ62167 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddx3xQ62167 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddx3xQ62167 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddx3xQ62167 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddx3xQ62167 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddx3xQ62167 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ddx3xQ62167 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ddx3xQ62167 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ddx3xQ62167 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ddx3xQ62167 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ddx3xQ62167 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ddx3xQ62167 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ddx3xQ62167 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ddx3xQ62167 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddx3xQ62167 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddx3xQ62167 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddx3xQ62167 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ddx3xQ62167 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddx3xQ62167 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddx3xQ62167 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddx3xQ62167 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddx3xQ62167 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddx3xQ62167 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ddx3xQ62167 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddx3xQ62167 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddx3xQ62167 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ddx3xQ62167 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddx3xQ62167 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddx3xQ62167 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddx3xQ62167 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddx3xQ62167 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddx3xQ62167 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddx3xQ62167 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ddx3xQ62167 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddx3xQ62167 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddx3xQ62167 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddx3xQ62167 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddx3xQ62167 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddx3xQ62167 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ddx3xQ62167 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ddx3xQ62167 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ddx3xQ62167 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ddx3xQ62167 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddx3xQ62167 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddx3xQ62167 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddx3xQ62167 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddx3xQ62167 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddx3xQ62167 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddx3xQ62167 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddx3xQ62167 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddx3xQ62167 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddx3xQ62167 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddx3xQ62167 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddx3xQ62167 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddx3xQ62167 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddx3xQ62167 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddx3xQ62167 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddx3xQ62167 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddx3xQ62167 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ddx3xQ62167 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ddx3xQ62167 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ddx3xQ62167 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ddx3xQ62167 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ddx3xQ62167 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ddx3xQ62167 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ddx3xQ62167 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ddx3xQ62167 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddx3xQ62167 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddx3xQ62167 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddx3xQ62167 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddx3xQ62167 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddx3xQ62167 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddx3xQ62167 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms