Protein–RNA interactions for Protein: Q61830

Mrc1, Macrophage mannose receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrc1Q61830 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Mrc1Q61830 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Mrc1Q61830 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Mrc1Q61830 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Mrc1Q61830 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Mrc1Q61830 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Mrc1Q61830 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Mrc1Q61830 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Mrc1Q61830 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Mrc1Q61830 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Mrc1Q61830 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Mrc1Q61830 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Mrc1Q61830 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Mrc1Q61830 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Mrc1Q61830 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Mrc1Q61830 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Mrc1Q61830 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Mrc1Q61830 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Mrc1Q61830 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Mrc1Q61830 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Mrc1Q61830 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Mrc1Q61830 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mrc1Q61830 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mrc1Q61830 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mrc1Q61830 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mrc1Q61830 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Mrc1Q61830 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Mrc1Q61830 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Mrc1Q61830 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Mrc1Q61830 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Mrc1Q61830 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Mrc1Q61830 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Mrc1Q61830 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Mrc1Q61830 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Mrc1Q61830 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Mrc1Q61830 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Mrc1Q61830 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Mrc1Q61830 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Mrc1Q61830 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Mrc1Q61830 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Mrc1Q61830 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mrc1Q61830 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mrc1Q61830 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mrc1Q61830 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mrc1Q61830 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Mrc1Q61830 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Mrc1Q61830 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Mrc1Q61830 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Mrc1Q61830 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Mrc1Q61830 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Mrc1Q61830 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Mrc1Q61830 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Mrc1Q61830 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Mrc1Q61830 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Mrc1Q61830 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mrc1Q61830 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mrc1Q61830 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mrc1Q61830 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mrc1Q61830 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mrc1Q61830 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Mrc1Q61830 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Mrc1Q61830 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Mrc1Q61830 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Mrc1Q61830 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Mrc1Q61830 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Mrc1Q61830 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Mrc1Q61830 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Mrc1Q61830 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Mrc1Q61830 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Mrc1Q61830 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mrc1Q61830 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mrc1Q61830 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mrc1Q61830 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mrc1Q61830 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mrc1Q61830 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Mrc1Q61830 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Mrc1Q61830 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Mrc1Q61830 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Mrc1Q61830 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Mrc1Q61830 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Mrc1Q61830 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Mrc1Q61830 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Mrc1Q61830 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Mrc1Q61830 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Mrc1Q61830 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Mrc1Q61830 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Mrc1Q61830 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Mrc1Q61830 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Mrc1Q61830 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Mrc1Q61830 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Mrc1Q61830 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Mrc1Q61830 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Mrc1Q61830 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Mrc1Q61830 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Mrc1Q61830 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Mrc1Q61830 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Mrc1Q61830 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Mrc1Q61830 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Mrc1Q61830 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Mrc1Q61830 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms