Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ecm1Q61508 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ecm1Q61508 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ecm1Q61508 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ecm1Q61508 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ecm1Q61508 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ecm1Q61508 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ecm1Q61508 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ecm1Q61508 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ecm1Q61508 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ecm1Q61508 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ecm1Q61508 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ecm1Q61508 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ecm1Q61508 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ecm1Q61508 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ecm1Q61508 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ecm1Q61508 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ecm1Q61508 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ecm1Q61508 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ecm1Q61508 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ecm1Q61508 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ecm1Q61508 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ecm1Q61508 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ecm1Q61508 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ecm1Q61508 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ecm1Q61508 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ecm1Q61508 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ecm1Q61508 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ecm1Q61508 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ecm1Q61508 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ecm1Q61508 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ecm1Q61508 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ecm1Q61508 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ecm1Q61508 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ecm1Q61508 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ecm1Q61508 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ecm1Q61508 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ecm1Q61508 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ecm1Q61508 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ecm1Q61508 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ecm1Q61508 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ecm1Q61508 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ecm1Q61508 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ecm1Q61508 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ecm1Q61508 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ecm1Q61508 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ecm1Q61508 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ecm1Q61508 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ecm1Q61508 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ecm1Q61508 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ecm1Q61508 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ecm1Q61508 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ecm1Q61508 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ecm1Q61508 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ecm1Q61508 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ecm1Q61508 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ecm1Q61508 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ecm1Q61508 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ecm1Q61508 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ecm1Q61508 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ecm1Q61508 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ecm1Q61508 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ecm1Q61508 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ecm1Q61508 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ecm1Q61508 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ecm1Q61508 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ecm1Q61508 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ecm1Q61508 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ecm1Q61508 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ecm1Q61508 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ecm1Q61508 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ecm1Q61508 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ecm1Q61508 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ecm1Q61508 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ecm1Q61508 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ecm1Q61508 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ecm1Q61508 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ecm1Q61508 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ecm1Q61508 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ecm1Q61508 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ecm1Q61508 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ecm1Q61508 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ecm1Q61508 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ecm1Q61508 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ecm1Q61508 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ecm1Q61508 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ecm1Q61508 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ecm1Q61508 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ecm1Q61508 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ecm1Q61508 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ecm1Q61508 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ecm1Q61508 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ecm1Q61508 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ecm1Q61508 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ecm1Q61508 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ecm1Q61508 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ecm1Q61508 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ecm1Q61508 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ecm1Q61508 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ecm1Q61508 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms