Protein–RNA interactions for Protein: Q61456

Ccna1, Cyclin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccna1Q61456 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccna1Q61456 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccna1Q61456 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccna1Q61456 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccna1Q61456 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccna1Q61456 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccna1Q61456 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccna1Q61456 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccna1Q61456 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccna1Q61456 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccna1Q61456 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccna1Q61456 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccna1Q61456 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccna1Q61456 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccna1Q61456 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccna1Q61456 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccna1Q61456 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccna1Q61456 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccna1Q61456 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccna1Q61456 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccna1Q61456 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccna1Q61456 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccna1Q61456 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccna1Q61456 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccna1Q61456 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccna1Q61456 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccna1Q61456 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccna1Q61456 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccna1Q61456 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccna1Q61456 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccna1Q61456 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccna1Q61456 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccna1Q61456 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccna1Q61456 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccna1Q61456 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccna1Q61456 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccna1Q61456 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccna1Q61456 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccna1Q61456 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccna1Q61456 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccna1Q61456 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccna1Q61456 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccna1Q61456 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccna1Q61456 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccna1Q61456 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccna1Q61456 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccna1Q61456 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccna1Q61456 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccna1Q61456 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccna1Q61456 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccna1Q61456 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccna1Q61456 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccna1Q61456 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccna1Q61456 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccna1Q61456 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccna1Q61456 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccna1Q61456 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccna1Q61456 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccna1Q61456 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccna1Q61456 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccna1Q61456 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccna1Q61456 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccna1Q61456 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccna1Q61456 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccna1Q61456 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccna1Q61456 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccna1Q61456 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccna1Q61456 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccna1Q61456 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccna1Q61456 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccna1Q61456 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccna1Q61456 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccna1Q61456 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccna1Q61456 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccna1Q61456 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccna1Q61456 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccna1Q61456 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccna1Q61456 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccna1Q61456 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccna1Q61456 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccna1Q61456 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccna1Q61456 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccna1Q61456 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccna1Q61456 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccna1Q61456 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccna1Q61456 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccna1Q61456 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccna1Q61456 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccna1Q61456 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccna1Q61456 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccna1Q61456 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccna1Q61456 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccna1Q61456 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccna1Q61456 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccna1Q61456 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccna1Q61456 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccna1Q61456 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccna1Q61456 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccna1Q61456 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccna1Q61456 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms