Protein–RNA interactions for Protein: Q61409

Pde3b, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3bQ61409 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pde3bQ61409 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pde3bQ61409 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pde3bQ61409 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Pde3bQ61409 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Pde3bQ61409 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pde3bQ61409 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pde3bQ61409 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pde3bQ61409 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pde3bQ61409 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pde3bQ61409 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pde3bQ61409 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pde3bQ61409 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pde3bQ61409 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pde3bQ61409 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pde3bQ61409 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pde3bQ61409 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pde3bQ61409 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pde3bQ61409 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pde3bQ61409 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pde3bQ61409 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pde3bQ61409 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pde3bQ61409 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pde3bQ61409 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pde3bQ61409 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pde3bQ61409 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pde3bQ61409 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pde3bQ61409 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pde3bQ61409 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pde3bQ61409 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pde3bQ61409 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pde3bQ61409 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pde3bQ61409 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pde3bQ61409 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pde3bQ61409 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pde3bQ61409 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pde3bQ61409 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pde3bQ61409 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pde3bQ61409 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pde3bQ61409 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pde3bQ61409 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pde3bQ61409 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pde3bQ61409 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pde3bQ61409 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pde3bQ61409 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pde3bQ61409 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pde3bQ61409 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pde3bQ61409 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pde3bQ61409 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pde3bQ61409 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pde3bQ61409 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pde3bQ61409 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pde3bQ61409 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pde3bQ61409 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pde3bQ61409 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pde3bQ61409 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pde3bQ61409 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pde3bQ61409 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Pde3bQ61409 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pde3bQ61409 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pde3bQ61409 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pde3bQ61409 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pde3bQ61409 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pde3bQ61409 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pde3bQ61409 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pde3bQ61409 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pde3bQ61409 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pde3bQ61409 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pde3bQ61409 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Pde3bQ61409 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pde3bQ61409 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pde3bQ61409 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Pde3bQ61409 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pde3bQ61409 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pde3bQ61409 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pde3bQ61409 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pde3bQ61409 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pde3bQ61409 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pde3bQ61409 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pde3bQ61409 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pde3bQ61409 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pde3bQ61409 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pde3bQ61409 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pde3bQ61409 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pde3bQ61409 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pde3bQ61409 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pde3bQ61409 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pde3bQ61409 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pde3bQ61409 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pde3bQ61409 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pde3bQ61409 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pde3bQ61409 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pde3bQ61409 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pde3bQ61409 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pde3bQ61409 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pde3bQ61409 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pde3bQ61409 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Pde3bQ61409 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pde3bQ61409 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pde3bQ61409 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms